Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD0

FBXO8, F-box only protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO8Q9NRD0 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FBXO8Q9NRD0 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FBXO8Q9NRD0 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FBXO8Q9NRD0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FBXO8Q9NRD0 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FBXO8Q9NRD0 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FBXO8Q9NRD0 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FBXO8Q9NRD0 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FBXO8Q9NRD0 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FBXO8Q9NRD0 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FBXO8Q9NRD0 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FBXO8Q9NRD0 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FBXO8Q9NRD0 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FBXO8Q9NRD0 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FBXO8Q9NRD0 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FBXO8Q9NRD0 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FBXO8Q9NRD0 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FBXO8Q9NRD0 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
FBXO8Q9NRD0 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FBXO8Q9NRD0 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FBXO8Q9NRD0 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
FBXO8Q9NRD0 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FBXO8Q9NRD0 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FBXO8Q9NRD0 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FBXO8Q9NRD0 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FBXO8Q9NRD0 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FBXO8Q9NRD0 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FBXO8Q9NRD0 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FBXO8Q9NRD0 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FBXO8Q9NRD0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FBXO8Q9NRD0 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FBXO8Q9NRD0 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FBXO8Q9NRD0 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FBXO8Q9NRD0 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FBXO8Q9NRD0 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FBXO8Q9NRD0 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FBXO8Q9NRD0 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FBXO8Q9NRD0 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FBXO8Q9NRD0 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FBXO8Q9NRD0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FBXO8Q9NRD0 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FBXO8Q9NRD0 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FBXO8Q9NRD0 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FBXO8Q9NRD0 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FBXO8Q9NRD0 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FBXO8Q9NRD0 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FBXO8Q9NRD0 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
FBXO8Q9NRD0 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
FBXO8Q9NRD0 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FBXO8Q9NRD0 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FBXO8Q9NRD0 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FBXO8Q9NRD0 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FBXO8Q9NRD0 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FBXO8Q9NRD0 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FBXO8Q9NRD0 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FBXO8Q9NRD0 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FBXO8Q9NRD0 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FBXO8Q9NRD0 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FBXO8Q9NRD0 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FBXO8Q9NRD0 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FBXO8Q9NRD0 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FBXO8Q9NRD0 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
FBXO8Q9NRD0 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FBXO8Q9NRD0 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FBXO8Q9NRD0 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FBXO8Q9NRD0 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FBXO8Q9NRD0 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FBXO8Q9NRD0 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FBXO8Q9NRD0 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FBXO8Q9NRD0 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FBXO8Q9NRD0 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FBXO8Q9NRD0 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
FBXO8Q9NRD0 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FBXO8Q9NRD0 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FBXO8Q9NRD0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FBXO8Q9NRD0 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FBXO8Q9NRD0 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FBXO8Q9NRD0 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FBXO8Q9NRD0 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FBXO8Q9NRD0 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FBXO8Q9NRD0 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FBXO8Q9NRD0 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FBXO8Q9NRD0 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FBXO8Q9NRD0 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
FBXO8Q9NRD0 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FBXO8Q9NRD0 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FBXO8Q9NRD0 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FBXO8Q9NRD0 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FBXO8Q9NRD0 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FBXO8Q9NRD0 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FBXO8Q9NRD0 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FBXO8Q9NRD0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
FBXO8Q9NRD0 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
FBXO8Q9NRD0 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
FBXO8Q9NRD0 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
FBXO8Q9NRD0 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
FBXO8Q9NRD0 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
FBXO8Q9NRD0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FBXO8Q9NRD0 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FBXO8Q9NRD0 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms