Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6D8

FNDC4, Fibronectin type III domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC4Q9H6D8 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNDC4Q9H6D8 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNDC4Q9H6D8 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNDC4Q9H6D8 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNDC4Q9H6D8 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNDC4Q9H6D8 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNDC4Q9H6D8 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNDC4Q9H6D8 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNDC4Q9H6D8 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNDC4Q9H6D8 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FNDC4Q9H6D8 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNDC4Q9H6D8 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNDC4Q9H6D8 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNDC4Q9H6D8 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNDC4Q9H6D8 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNDC4Q9H6D8 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNDC4Q9H6D8 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNDC4Q9H6D8 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNDC4Q9H6D8 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNDC4Q9H6D8 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNDC4Q9H6D8 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNDC4Q9H6D8 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNDC4Q9H6D8 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNDC4Q9H6D8 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNDC4Q9H6D8 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FNDC4Q9H6D8 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNDC4Q9H6D8 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNDC4Q9H6D8 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNDC4Q9H6D8 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNDC4Q9H6D8 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNDC4Q9H6D8 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FNDC4Q9H6D8 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNDC4Q9H6D8 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNDC4Q9H6D8 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNDC4Q9H6D8 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNDC4Q9H6D8 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNDC4Q9H6D8 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNDC4Q9H6D8 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNDC4Q9H6D8 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNDC4Q9H6D8 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNDC4Q9H6D8 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNDC4Q9H6D8 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNDC4Q9H6D8 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNDC4Q9H6D8 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNDC4Q9H6D8 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNDC4Q9H6D8 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FNDC4Q9H6D8 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNDC4Q9H6D8 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FNDC4Q9H6D8 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNDC4Q9H6D8 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNDC4Q9H6D8 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNDC4Q9H6D8 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNDC4Q9H6D8 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNDC4Q9H6D8 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNDC4Q9H6D8 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FNDC4Q9H6D8 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FNDC4Q9H6D8 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FNDC4Q9H6D8 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FNDC4Q9H6D8 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FNDC4Q9H6D8 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FNDC4Q9H6D8 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FNDC4Q9H6D8 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FNDC4Q9H6D8 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FNDC4Q9H6D8 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FNDC4Q9H6D8 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FNDC4Q9H6D8 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FNDC4Q9H6D8 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FNDC4Q9H6D8 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FNDC4Q9H6D8 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FNDC4Q9H6D8 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
FNDC4Q9H6D8 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
FNDC4Q9H6D8 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FNDC4Q9H6D8 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FNDC4Q9H6D8 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FNDC4Q9H6D8 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
FNDC4Q9H6D8 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
FNDC4Q9H6D8 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
FNDC4Q9H6D8 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FNDC4Q9H6D8 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FNDC4Q9H6D8 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
FNDC4Q9H6D8 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
FNDC4Q9H6D8 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FNDC4Q9H6D8 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
FNDC4Q9H6D8 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FNDC4Q9H6D8 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FNDC4Q9H6D8 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FNDC4Q9H6D8 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
FNDC4Q9H6D8 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FNDC4Q9H6D8 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FNDC4Q9H6D8 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FNDC4Q9H6D8 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FNDC4Q9H6D8 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FNDC4Q9H6D8 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FNDC4Q9H6D8 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FNDC4Q9H6D8 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FNDC4Q9H6D8 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FNDC4Q9H6D8 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FNDC4Q9H6D8 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FNDC4Q9H6D8 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FNDC4Q9H6D8 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms