Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY5

CRAMP1, Protein cramped-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRAMP1Q96RY5 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CRAMP1Q96RY5 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CRAMP1Q96RY5 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CRAMP1Q96RY5 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CRAMP1Q96RY5 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CRAMP1Q96RY5 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CRAMP1Q96RY5 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CRAMP1Q96RY5 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CRAMP1Q96RY5 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CRAMP1Q96RY5 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CRAMP1Q96RY5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CRAMP1Q96RY5 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CRAMP1Q96RY5 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CRAMP1Q96RY5 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CRAMP1Q96RY5 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CRAMP1Q96RY5 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CRAMP1Q96RY5 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CRAMP1Q96RY5 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CRAMP1Q96RY5 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CRAMP1Q96RY5 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CRAMP1Q96RY5 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CRAMP1Q96RY5 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CRAMP1Q96RY5 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CRAMP1Q96RY5 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CRAMP1Q96RY5 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CRAMP1Q96RY5 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CRAMP1Q96RY5 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CRAMP1Q96RY5 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CRAMP1Q96RY5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CRAMP1Q96RY5 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CRAMP1Q96RY5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CRAMP1Q96RY5 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CRAMP1Q96RY5 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CRAMP1Q96RY5 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CRAMP1Q96RY5 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CRAMP1Q96RY5 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CRAMP1Q96RY5 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CRAMP1Q96RY5 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CRAMP1Q96RY5 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CRAMP1Q96RY5 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CRAMP1Q96RY5 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CRAMP1Q96RY5 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CRAMP1Q96RY5 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CRAMP1Q96RY5 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CRAMP1Q96RY5 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CRAMP1Q96RY5 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CRAMP1Q96RY5 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CRAMP1Q96RY5 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CRAMP1Q96RY5 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CRAMP1Q96RY5 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CRAMP1Q96RY5 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CRAMP1Q96RY5 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CRAMP1Q96RY5 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CRAMP1Q96RY5 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CRAMP1Q96RY5 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CRAMP1Q96RY5 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CRAMP1Q96RY5 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CRAMP1Q96RY5 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CRAMP1Q96RY5 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CRAMP1Q96RY5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CRAMP1Q96RY5 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CRAMP1Q96RY5 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CRAMP1Q96RY5 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CRAMP1Q96RY5 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CRAMP1Q96RY5 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CRAMP1Q96RY5 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CRAMP1Q96RY5 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CRAMP1Q96RY5 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CRAMP1Q96RY5 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CRAMP1Q96RY5 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CRAMP1Q96RY5 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CRAMP1Q96RY5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CRAMP1Q96RY5 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CRAMP1Q96RY5 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CRAMP1Q96RY5 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CRAMP1Q96RY5 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CRAMP1Q96RY5 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CRAMP1Q96RY5 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CRAMP1Q96RY5 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CRAMP1Q96RY5 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CRAMP1Q96RY5 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CRAMP1Q96RY5 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CRAMP1Q96RY5 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CRAMP1Q96RY5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CRAMP1Q96RY5 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CRAMP1Q96RY5 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CRAMP1Q96RY5 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CRAMP1Q96RY5 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CRAMP1Q96RY5 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CRAMP1Q96RY5 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CRAMP1Q96RY5 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CRAMP1Q96RY5 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CRAMP1Q96RY5 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CRAMP1Q96RY5 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CRAMP1Q96RY5 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CRAMP1Q96RY5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CRAMP1Q96RY5 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CRAMP1Q96RY5 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CRAMP1Q96RY5 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.68
CRAMP1Q96RY5 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms