Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW1

CCDC43, Coiled-coil domain-containing protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC43Q96MW1 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC43Q96MW1 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC43Q96MW1 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC43Q96MW1 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC43Q96MW1 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC43Q96MW1 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC43Q96MW1 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC43Q96MW1 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC43Q96MW1 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC43Q96MW1 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC43Q96MW1 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC43Q96MW1 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC43Q96MW1 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC43Q96MW1 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC43Q96MW1 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC43Q96MW1 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC43Q96MW1 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC43Q96MW1 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC43Q96MW1 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC43Q96MW1 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC43Q96MW1 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC43Q96MW1 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC43Q96MW1 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC43Q96MW1 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC43Q96MW1 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC43Q96MW1 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC43Q96MW1 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC43Q96MW1 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC43Q96MW1 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC43Q96MW1 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC43Q96MW1 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC43Q96MW1 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC43Q96MW1 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC43Q96MW1 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC43Q96MW1 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC43Q96MW1 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC43Q96MW1 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC43Q96MW1 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC43Q96MW1 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC43Q96MW1 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC43Q96MW1 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC43Q96MW1 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC43Q96MW1 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC43Q96MW1 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC43Q96MW1 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC43Q96MW1 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC43Q96MW1 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC43Q96MW1 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC43Q96MW1 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC43Q96MW1 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC43Q96MW1 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC43Q96MW1 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC43Q96MW1 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC43Q96MW1 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC43Q96MW1 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC43Q96MW1 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC43Q96MW1 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC43Q96MW1 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC43Q96MW1 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC43Q96MW1 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC43Q96MW1 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC43Q96MW1 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC43Q96MW1 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC43Q96MW1 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC43Q96MW1 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC43Q96MW1 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC43Q96MW1 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC43Q96MW1 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC43Q96MW1 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC43Q96MW1 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC43Q96MW1 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC43Q96MW1 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC43Q96MW1 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC43Q96MW1 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC43Q96MW1 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC43Q96MW1 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC43Q96MW1 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC43Q96MW1 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC43Q96MW1 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC43Q96MW1 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC43Q96MW1 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC43Q96MW1 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC43Q96MW1 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC43Q96MW1 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC43Q96MW1 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC43Q96MW1 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC43Q96MW1 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC43Q96MW1 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC43Q96MW1 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC43Q96MW1 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC43Q96MW1 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC43Q96MW1 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC43Q96MW1 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC43Q96MW1 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC43Q96MW1 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC43Q96MW1 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC43Q96MW1 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC43Q96MW1 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC43Q96MW1 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC43Q96MW1 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms