Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW2

SHD, SH2 domain-containing adapter protein D, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHDQ96IW2 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SHDQ96IW2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SHDQ96IW2 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SHDQ96IW2 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SHDQ96IW2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SHDQ96IW2 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SHDQ96IW2 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SHDQ96IW2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SHDQ96IW2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SHDQ96IW2 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SHDQ96IW2 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SHDQ96IW2 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SHDQ96IW2 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SHDQ96IW2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SHDQ96IW2 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SHDQ96IW2 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SHDQ96IW2 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SHDQ96IW2 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SHDQ96IW2 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SHDQ96IW2 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SHDQ96IW2 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SHDQ96IW2 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SHDQ96IW2 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SHDQ96IW2 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SHDQ96IW2 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SHDQ96IW2 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SHDQ96IW2 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SHDQ96IW2 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SHDQ96IW2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SHDQ96IW2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SHDQ96IW2 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SHDQ96IW2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SHDQ96IW2 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SHDQ96IW2 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SHDQ96IW2 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SHDQ96IW2 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SHDQ96IW2 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SHDQ96IW2 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SHDQ96IW2 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SHDQ96IW2 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SHDQ96IW2 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SHDQ96IW2 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SHDQ96IW2 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SHDQ96IW2 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SHDQ96IW2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SHDQ96IW2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SHDQ96IW2 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SHDQ96IW2 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SHDQ96IW2 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SHDQ96IW2 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SHDQ96IW2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SHDQ96IW2 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SHDQ96IW2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SHDQ96IW2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SHDQ96IW2 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SHDQ96IW2 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SHDQ96IW2 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SHDQ96IW2 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SHDQ96IW2 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SHDQ96IW2 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SHDQ96IW2 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SHDQ96IW2 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SHDQ96IW2 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SHDQ96IW2 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SHDQ96IW2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SHDQ96IW2 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SHDQ96IW2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SHDQ96IW2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SHDQ96IW2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SHDQ96IW2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SHDQ96IW2 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SHDQ96IW2 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SHDQ96IW2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SHDQ96IW2 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SHDQ96IW2 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SHDQ96IW2 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SHDQ96IW2 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SHDQ96IW2 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SHDQ96IW2 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SHDQ96IW2 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SHDQ96IW2 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SHDQ96IW2 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SHDQ96IW2 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SHDQ96IW2 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SHDQ96IW2 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SHDQ96IW2 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SHDQ96IW2 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SHDQ96IW2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SHDQ96IW2 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SHDQ96IW2 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SHDQ96IW2 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SHDQ96IW2 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SHDQ96IW2 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SHDQ96IW2 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SHDQ96IW2 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SHDQ96IW2 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SHDQ96IW2 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SHDQ96IW2 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SHDQ96IW2 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SHDQ96IW2 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms