Protein–RNA interactions for Protein: Q92572

AP3S1, AP-3 complex subunit sigma-1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3S1Q92572 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AP3S1Q92572 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
AP3S1Q92572 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AP3S1Q92572 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AP3S1Q92572 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
AP3S1Q92572 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AP3S1Q92572 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AP3S1Q92572 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AP3S1Q92572 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AP3S1Q92572 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AP3S1Q92572 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AP3S1Q92572 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AP3S1Q92572 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AP3S1Q92572 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AP3S1Q92572 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AP3S1Q92572 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AP3S1Q92572 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AP3S1Q92572 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AP3S1Q92572 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AP3S1Q92572 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AP3S1Q92572 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AP3S1Q92572 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AP3S1Q92572 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AP3S1Q92572 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AP3S1Q92572 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AP3S1Q92572 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AP3S1Q92572 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AP3S1Q92572 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AP3S1Q92572 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AP3S1Q92572 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AP3S1Q92572 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AP3S1Q92572 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AP3S1Q92572 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AP3S1Q92572 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AP3S1Q92572 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AP3S1Q92572 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AP3S1Q92572 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AP3S1Q92572 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AP3S1Q92572 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AP3S1Q92572 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AP3S1Q92572 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AP3S1Q92572 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AP3S1Q92572 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AP3S1Q92572 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AP3S1Q92572 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AP3S1Q92572 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AP3S1Q92572 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AP3S1Q92572 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AP3S1Q92572 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AP3S1Q92572 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AP3S1Q92572 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AP3S1Q92572 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AP3S1Q92572 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AP3S1Q92572 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AP3S1Q92572 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AP3S1Q92572 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AP3S1Q92572 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AP3S1Q92572 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AP3S1Q92572 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AP3S1Q92572 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AP3S1Q92572 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AP3S1Q92572 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AP3S1Q92572 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AP3S1Q92572 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AP3S1Q92572 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AP3S1Q92572 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AP3S1Q92572 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AP3S1Q92572 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AP3S1Q92572 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AP3S1Q92572 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AP3S1Q92572 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AP3S1Q92572 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AP3S1Q92572 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AP3S1Q92572 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AP3S1Q92572 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AP3S1Q92572 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AP3S1Q92572 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AP3S1Q92572 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AP3S1Q92572 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AP3S1Q92572 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AP3S1Q92572 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AP3S1Q92572 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
AP3S1Q92572 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AP3S1Q92572 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AP3S1Q92572 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AP3S1Q92572 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AP3S1Q92572 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AP3S1Q92572 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
AP3S1Q92572 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AP3S1Q92572 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AP3S1Q92572 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AP3S1Q92572 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AP3S1Q92572 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AP3S1Q92572 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AP3S1Q92572 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AP3S1Q92572 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AP3S1Q92572 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AP3S1Q92572 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
AP3S1Q92572 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AP3S1Q92572 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms