Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVY7

UBLCP1, Ubiquitin-like domain-containing CTD phosphatase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBLCP1Q8WVY7 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBLCP1Q8WVY7 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
UBLCP1Q8WVY7 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBLCP1Q8WVY7 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
UBLCP1Q8WVY7 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBLCP1Q8WVY7 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
UBLCP1Q8WVY7 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
UBLCP1Q8WVY7 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
UBLCP1Q8WVY7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
UBLCP1Q8WVY7 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
UBLCP1Q8WVY7 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBLCP1Q8WVY7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
UBLCP1Q8WVY7 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
UBLCP1Q8WVY7 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBLCP1Q8WVY7 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
UBLCP1Q8WVY7 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBLCP1Q8WVY7 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.31■■□□□ 1
UBLCP1Q8WVY7 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBLCP1Q8WVY7 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
UBLCP1Q8WVY7 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBLCP1Q8WVY7 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBLCP1Q8WVY7 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
UBLCP1Q8WVY7 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBLCP1Q8WVY7 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
UBLCP1Q8WVY7 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBLCP1Q8WVY7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBLCP1Q8WVY7 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBLCP1Q8WVY7 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
UBLCP1Q8WVY7 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBLCP1Q8WVY7 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBLCP1Q8WVY7 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.3■■□□□ 1
UBLCP1Q8WVY7 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBLCP1Q8WVY7 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
UBLCP1Q8WVY7 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBLCP1Q8WVY7 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBLCP1Q8WVY7 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBLCP1Q8WVY7 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBLCP1Q8WVY7 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBLCP1Q8WVY7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
UBLCP1Q8WVY7 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBLCP1Q8WVY7 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBLCP1Q8WVY7 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBLCP1Q8WVY7 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBLCP1Q8WVY7 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBLCP1Q8WVY7 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBLCP1Q8WVY7 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBLCP1Q8WVY7 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBLCP1Q8WVY7 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBLCP1Q8WVY7 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBLCP1Q8WVY7 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBLCP1Q8WVY7 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
UBLCP1Q8WVY7 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBLCP1Q8WVY7 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBLCP1Q8WVY7 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBLCP1Q8WVY7 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBLCP1Q8WVY7 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
UBLCP1Q8WVY7 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
UBLCP1Q8WVY7 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.29■■□□□ 1
UBLCP1Q8WVY7 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBLCP1Q8WVY7 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBLCP1Q8WVY7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
UBLCP1Q8WVY7 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBLCP1Q8WVY7 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
UBLCP1Q8WVY7 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
UBLCP1Q8WVY7 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
UBLCP1Q8WVY7 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBLCP1Q8WVY7 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBLCP1Q8WVY7 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBLCP1Q8WVY7 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBLCP1Q8WVY7 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBLCP1Q8WVY7 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
UBLCP1Q8WVY7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBLCP1Q8WVY7 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBLCP1Q8WVY7 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBLCP1Q8WVY7 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBLCP1Q8WVY7 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBLCP1Q8WVY7 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBLCP1Q8WVY7 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBLCP1Q8WVY7 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
UBLCP1Q8WVY7 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBLCP1Q8WVY7 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBLCP1Q8WVY7 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
UBLCP1Q8WVY7 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
UBLCP1Q8WVY7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBLCP1Q8WVY7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBLCP1Q8WVY7 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBLCP1Q8WVY7 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
UBLCP1Q8WVY7 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBLCP1Q8WVY7 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBLCP1Q8WVY7 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.27■■□□□ 1
UBLCP1Q8WVY7 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBLCP1Q8WVY7 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
UBLCP1Q8WVY7 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
UBLCP1Q8WVY7 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
UBLCP1Q8WVY7 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
UBLCP1Q8WVY7 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBLCP1Q8WVY7 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBLCP1Q8WVY7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBLCP1Q8WVY7 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
UBLCP1Q8WVY7 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms