Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW8

TTC21A, Tetratricopeptide repeat protein 21A, humanhuman

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC21AQ8NDW8 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TTC21AQ8NDW8 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
TTC21AQ8NDW8 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
TTC21AQ8NDW8 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
TTC21AQ8NDW8 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
TTC21AQ8NDW8 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
TTC21AQ8NDW8 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
TTC21AQ8NDW8 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.09
TTC21AQ8NDW8 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
TTC21AQ8NDW8 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.09
TTC21AQ8NDW8 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.09
TTC21AQ8NDW8 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
TTC21AQ8NDW8 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TTC21AQ8NDW8 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TTC21AQ8NDW8 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TTC21AQ8NDW8 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TTC21AQ8NDW8 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TTC21AQ8NDW8 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TTC21AQ8NDW8 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TTC21AQ8NDW8 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TTC21AQ8NDW8 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
TTC21AQ8NDW8 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TTC21AQ8NDW8 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TTC21AQ8NDW8 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TTC21AQ8NDW8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TTC21AQ8NDW8 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TTC21AQ8NDW8 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
TTC21AQ8NDW8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TTC21AQ8NDW8 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TTC21AQ8NDW8 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TTC21AQ8NDW8 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TTC21AQ8NDW8 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TTC21AQ8NDW8 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TTC21AQ8NDW8 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TTC21AQ8NDW8 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
TTC21AQ8NDW8 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TTC21AQ8NDW8 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TTC21AQ8NDW8 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TTC21AQ8NDW8 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TTC21AQ8NDW8 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TTC21AQ8NDW8 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TTC21AQ8NDW8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TTC21AQ8NDW8 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
TTC21AQ8NDW8 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TTC21AQ8NDW8 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TTC21AQ8NDW8 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TTC21AQ8NDW8 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TTC21AQ8NDW8 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TTC21AQ8NDW8 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TTC21AQ8NDW8 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TTC21AQ8NDW8 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TTC21AQ8NDW8 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TTC21AQ8NDW8 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TTC21AQ8NDW8 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TTC21AQ8NDW8 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TTC21AQ8NDW8 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TTC21AQ8NDW8 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TTC21AQ8NDW8 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TTC21AQ8NDW8 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TTC21AQ8NDW8 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TTC21AQ8NDW8 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TTC21AQ8NDW8 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TTC21AQ8NDW8 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
TTC21AQ8NDW8 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TTC21AQ8NDW8 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TTC21AQ8NDW8 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TTC21AQ8NDW8 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
TTC21AQ8NDW8 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TTC21AQ8NDW8 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TTC21AQ8NDW8 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TTC21AQ8NDW8 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TTC21AQ8NDW8 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TTC21AQ8NDW8 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TTC21AQ8NDW8 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TTC21AQ8NDW8 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
TTC21AQ8NDW8 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
TTC21AQ8NDW8 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TTC21AQ8NDW8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TTC21AQ8NDW8 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TTC21AQ8NDW8 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TTC21AQ8NDW8 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TTC21AQ8NDW8 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TTC21AQ8NDW8 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TTC21AQ8NDW8 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TTC21AQ8NDW8 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TTC21AQ8NDW8 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TTC21AQ8NDW8 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TTC21AQ8NDW8 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TTC21AQ8NDW8 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.08
TTC21AQ8NDW8 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TTC21AQ8NDW8 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TTC21AQ8NDW8 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TTC21AQ8NDW8 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TTC21AQ8NDW8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TTC21AQ8NDW8 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TTC21AQ8NDW8 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TTC21AQ8NDW8 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TTC21AQ8NDW8 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
TTC21AQ8NDW8 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TTC21AQ8NDW8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms