Protein–RNA interactions for Protein: Q86XT2

VPS37D, Vacuolar protein sorting-associated protein 37D, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37DQ86XT2 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VPS37DQ86XT2 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VPS37DQ86XT2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VPS37DQ86XT2 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VPS37DQ86XT2 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VPS37DQ86XT2 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VPS37DQ86XT2 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VPS37DQ86XT2 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
VPS37DQ86XT2 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
VPS37DQ86XT2 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
VPS37DQ86XT2 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
VPS37DQ86XT2 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
VPS37DQ86XT2 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VPS37DQ86XT2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
VPS37DQ86XT2 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VPS37DQ86XT2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VPS37DQ86XT2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VPS37DQ86XT2 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VPS37DQ86XT2 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VPS37DQ86XT2 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
VPS37DQ86XT2 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VPS37DQ86XT2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VPS37DQ86XT2 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VPS37DQ86XT2 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VPS37DQ86XT2 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VPS37DQ86XT2 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
VPS37DQ86XT2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VPS37DQ86XT2 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VPS37DQ86XT2 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VPS37DQ86XT2 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VPS37DQ86XT2 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VPS37DQ86XT2 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VPS37DQ86XT2 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VPS37DQ86XT2 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VPS37DQ86XT2 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VPS37DQ86XT2 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VPS37DQ86XT2 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VPS37DQ86XT2 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VPS37DQ86XT2 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VPS37DQ86XT2 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VPS37DQ86XT2 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VPS37DQ86XT2 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VPS37DQ86XT2 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VPS37DQ86XT2 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VPS37DQ86XT2 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VPS37DQ86XT2 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VPS37DQ86XT2 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VPS37DQ86XT2 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VPS37DQ86XT2 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VPS37DQ86XT2 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VPS37DQ86XT2 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VPS37DQ86XT2 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VPS37DQ86XT2 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
VPS37DQ86XT2 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VPS37DQ86XT2 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
VPS37DQ86XT2 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VPS37DQ86XT2 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VPS37DQ86XT2 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VPS37DQ86XT2 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VPS37DQ86XT2 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VPS37DQ86XT2 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
VPS37DQ86XT2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VPS37DQ86XT2 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VPS37DQ86XT2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VPS37DQ86XT2 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
VPS37DQ86XT2 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
VPS37DQ86XT2 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
VPS37DQ86XT2 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
VPS37DQ86XT2 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VPS37DQ86XT2 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VPS37DQ86XT2 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VPS37DQ86XT2 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VPS37DQ86XT2 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VPS37DQ86XT2 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VPS37DQ86XT2 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VPS37DQ86XT2 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VPS37DQ86XT2 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VPS37DQ86XT2 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VPS37DQ86XT2 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VPS37DQ86XT2 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VPS37DQ86XT2 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VPS37DQ86XT2 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VPS37DQ86XT2 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VPS37DQ86XT2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VPS37DQ86XT2 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
VPS37DQ86XT2 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
VPS37DQ86XT2 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VPS37DQ86XT2 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VPS37DQ86XT2 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VPS37DQ86XT2 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VPS37DQ86XT2 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VPS37DQ86XT2 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VPS37DQ86XT2 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VPS37DQ86XT2 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VPS37DQ86XT2 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VPS37DQ86XT2 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VPS37DQ86XT2 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VPS37DQ86XT2 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VPS37DQ86XT2 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VPS37DQ86XT2 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms