Protein–RNA interactions for Protein: Q86UA1

PRPF39, Pre-mRNA-processing factor 39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF39Q86UA1 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRPF39Q86UA1 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PRPF39Q86UA1 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRPF39Q86UA1 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRPF39Q86UA1 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRPF39Q86UA1 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRPF39Q86UA1 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PRPF39Q86UA1 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRPF39Q86UA1 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRPF39Q86UA1 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPF39Q86UA1 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPF39Q86UA1 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPF39Q86UA1 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPF39Q86UA1 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPF39Q86UA1 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPF39Q86UA1 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPF39Q86UA1 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPF39Q86UA1 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPF39Q86UA1 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPF39Q86UA1 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPF39Q86UA1 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPF39Q86UA1 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPF39Q86UA1 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPF39Q86UA1 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPF39Q86UA1 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPF39Q86UA1 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPF39Q86UA1 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPF39Q86UA1 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPF39Q86UA1 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPF39Q86UA1 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPF39Q86UA1 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPF39Q86UA1 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRPF39Q86UA1 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRPF39Q86UA1 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRPF39Q86UA1 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRPF39Q86UA1 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRPF39Q86UA1 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRPF39Q86UA1 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PRPF39Q86UA1 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRPF39Q86UA1 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRPF39Q86UA1 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPF39Q86UA1 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPF39Q86UA1 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPF39Q86UA1 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPF39Q86UA1 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPF39Q86UA1 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPF39Q86UA1 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPF39Q86UA1 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPF39Q86UA1 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPF39Q86UA1 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPF39Q86UA1 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPF39Q86UA1 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPF39Q86UA1 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPF39Q86UA1 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPF39Q86UA1 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRPF39Q86UA1 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPF39Q86UA1 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPF39Q86UA1 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPF39Q86UA1 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPF39Q86UA1 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPF39Q86UA1 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPF39Q86UA1 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPF39Q86UA1 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPF39Q86UA1 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPF39Q86UA1 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPF39Q86UA1 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPF39Q86UA1 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPF39Q86UA1 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPF39Q86UA1 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPF39Q86UA1 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPF39Q86UA1 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPF39Q86UA1 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPF39Q86UA1 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPF39Q86UA1 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPF39Q86UA1 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPF39Q86UA1 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPF39Q86UA1 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRPF39Q86UA1 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRPF39Q86UA1 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRPF39Q86UA1 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRPF39Q86UA1 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRPF39Q86UA1 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRPF39Q86UA1 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRPF39Q86UA1 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRPF39Q86UA1 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRPF39Q86UA1 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRPF39Q86UA1 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRPF39Q86UA1 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRPF39Q86UA1 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRPF39Q86UA1 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRPF39Q86UA1 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRPF39Q86UA1 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRPF39Q86UA1 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRPF39Q86UA1 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PRPF39Q86UA1 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRPF39Q86UA1 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRPF39Q86UA1 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRPF39Q86UA1 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRPF39Q86UA1 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PRPF39Q86UA1 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms