Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZN66

GBP6, Guanylate-binding protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP6Q6ZN66 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GBP6Q6ZN66 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GBP6Q6ZN66 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GBP6Q6ZN66 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GBP6Q6ZN66 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GBP6Q6ZN66 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GBP6Q6ZN66 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GBP6Q6ZN66 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GBP6Q6ZN66 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GBP6Q6ZN66 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GBP6Q6ZN66 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GBP6Q6ZN66 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GBP6Q6ZN66 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GBP6Q6ZN66 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GBP6Q6ZN66 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GBP6Q6ZN66 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GBP6Q6ZN66 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GBP6Q6ZN66 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GBP6Q6ZN66 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GBP6Q6ZN66 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GBP6Q6ZN66 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GBP6Q6ZN66 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GBP6Q6ZN66 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GBP6Q6ZN66 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GBP6Q6ZN66 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GBP6Q6ZN66 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GBP6Q6ZN66 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GBP6Q6ZN66 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GBP6Q6ZN66 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GBP6Q6ZN66 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GBP6Q6ZN66 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GBP6Q6ZN66 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GBP6Q6ZN66 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GBP6Q6ZN66 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GBP6Q6ZN66 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GBP6Q6ZN66 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GBP6Q6ZN66 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GBP6Q6ZN66 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GBP6Q6ZN66 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GBP6Q6ZN66 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GBP6Q6ZN66 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GBP6Q6ZN66 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GBP6Q6ZN66 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GBP6Q6ZN66 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GBP6Q6ZN66 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GBP6Q6ZN66 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GBP6Q6ZN66 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GBP6Q6ZN66 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GBP6Q6ZN66 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GBP6Q6ZN66 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GBP6Q6ZN66 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GBP6Q6ZN66 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GBP6Q6ZN66 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GBP6Q6ZN66 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GBP6Q6ZN66 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GBP6Q6ZN66 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GBP6Q6ZN66 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GBP6Q6ZN66 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GBP6Q6ZN66 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GBP6Q6ZN66 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GBP6Q6ZN66 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GBP6Q6ZN66 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GBP6Q6ZN66 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GBP6Q6ZN66 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GBP6Q6ZN66 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GBP6Q6ZN66 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GBP6Q6ZN66 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GBP6Q6ZN66 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GBP6Q6ZN66 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GBP6Q6ZN66 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GBP6Q6ZN66 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GBP6Q6ZN66 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GBP6Q6ZN66 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GBP6Q6ZN66 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GBP6Q6ZN66 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GBP6Q6ZN66 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GBP6Q6ZN66 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GBP6Q6ZN66 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GBP6Q6ZN66 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GBP6Q6ZN66 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GBP6Q6ZN66 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GBP6Q6ZN66 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GBP6Q6ZN66 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GBP6Q6ZN66 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GBP6Q6ZN66 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GBP6Q6ZN66 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GBP6Q6ZN66 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GBP6Q6ZN66 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GBP6Q6ZN66 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GBP6Q6ZN66 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GBP6Q6ZN66 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GBP6Q6ZN66 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GBP6Q6ZN66 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GBP6Q6ZN66 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GBP6Q6ZN66 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GBP6Q6ZN66 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GBP6Q6ZN66 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GBP6Q6ZN66 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GBP6Q6ZN66 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GBP6Q6ZN66 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms