Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5L8

SHC4, SHC-transforming protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHC4Q6S5L8 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHC4Q6S5L8 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHC4Q6S5L8 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHC4Q6S5L8 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHC4Q6S5L8 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHC4Q6S5L8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHC4Q6S5L8 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHC4Q6S5L8 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHC4Q6S5L8 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHC4Q6S5L8 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHC4Q6S5L8 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SHC4Q6S5L8 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHC4Q6S5L8 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SHC4Q6S5L8 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHC4Q6S5L8 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SHC4Q6S5L8 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHC4Q6S5L8 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHC4Q6S5L8 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHC4Q6S5L8 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHC4Q6S5L8 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHC4Q6S5L8 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHC4Q6S5L8 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHC4Q6S5L8 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHC4Q6S5L8 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHC4Q6S5L8 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHC4Q6S5L8 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHC4Q6S5L8 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHC4Q6S5L8 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHC4Q6S5L8 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHC4Q6S5L8 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHC4Q6S5L8 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHC4Q6S5L8 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHC4Q6S5L8 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHC4Q6S5L8 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHC4Q6S5L8 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHC4Q6S5L8 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHC4Q6S5L8 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHC4Q6S5L8 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHC4Q6S5L8 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHC4Q6S5L8 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHC4Q6S5L8 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHC4Q6S5L8 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHC4Q6S5L8 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHC4Q6S5L8 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHC4Q6S5L8 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHC4Q6S5L8 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHC4Q6S5L8 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHC4Q6S5L8 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHC4Q6S5L8 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHC4Q6S5L8 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHC4Q6S5L8 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SHC4Q6S5L8 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SHC4Q6S5L8 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHC4Q6S5L8 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHC4Q6S5L8 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHC4Q6S5L8 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SHC4Q6S5L8 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHC4Q6S5L8 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHC4Q6S5L8 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHC4Q6S5L8 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHC4Q6S5L8 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHC4Q6S5L8 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SHC4Q6S5L8 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SHC4Q6S5L8 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SHC4Q6S5L8 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SHC4Q6S5L8 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SHC4Q6S5L8 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SHC4Q6S5L8 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SHC4Q6S5L8 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SHC4Q6S5L8 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SHC4Q6S5L8 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SHC4Q6S5L8 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SHC4Q6S5L8 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SHC4Q6S5L8 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SHC4Q6S5L8 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SHC4Q6S5L8 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SHC4Q6S5L8 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SHC4Q6S5L8 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SHC4Q6S5L8 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SHC4Q6S5L8 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SHC4Q6S5L8 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SHC4Q6S5L8 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SHC4Q6S5L8 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SHC4Q6S5L8 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SHC4Q6S5L8 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SHC4Q6S5L8 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SHC4Q6S5L8 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SHC4Q6S5L8 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SHC4Q6S5L8 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SHC4Q6S5L8 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SHC4Q6S5L8 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SHC4Q6S5L8 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SHC4Q6S5L8 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SHC4Q6S5L8 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SHC4Q6S5L8 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SHC4Q6S5L8 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SHC4Q6S5L8 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SHC4Q6S5L8 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SHC4Q6S5L8 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SHC4Q6S5L8 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms