Protein–RNA interactions for Protein: Q68G74

LHX8, LIM/homeobox protein Lhx8, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX8Q68G74 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LHX8Q68G74 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LHX8Q68G74 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LHX8Q68G74 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LHX8Q68G74 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LHX8Q68G74 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LHX8Q68G74 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LHX8Q68G74 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LHX8Q68G74 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LHX8Q68G74 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LHX8Q68G74 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LHX8Q68G74 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
LHX8Q68G74 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LHX8Q68G74 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LHX8Q68G74 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LHX8Q68G74 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LHX8Q68G74 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LHX8Q68G74 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
LHX8Q68G74 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
LHX8Q68G74 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LHX8Q68G74 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LHX8Q68G74 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LHX8Q68G74 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LHX8Q68G74 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LHX8Q68G74 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LHX8Q68G74 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LHX8Q68G74 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LHX8Q68G74 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
LHX8Q68G74 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LHX8Q68G74 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LHX8Q68G74 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LHX8Q68G74 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LHX8Q68G74 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LHX8Q68G74 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LHX8Q68G74 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LHX8Q68G74 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LHX8Q68G74 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LHX8Q68G74 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LHX8Q68G74 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LHX8Q68G74 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LHX8Q68G74 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LHX8Q68G74 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LHX8Q68G74 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LHX8Q68G74 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
LHX8Q68G74 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
LHX8Q68G74 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LHX8Q68G74 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LHX8Q68G74 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LHX8Q68G74 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LHX8Q68G74 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LHX8Q68G74 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
LHX8Q68G74 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LHX8Q68G74 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LHX8Q68G74 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LHX8Q68G74 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LHX8Q68G74 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LHX8Q68G74 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LHX8Q68G74 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LHX8Q68G74 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LHX8Q68G74 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LHX8Q68G74 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LHX8Q68G74 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LHX8Q68G74 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LHX8Q68G74 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LHX8Q68G74 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LHX8Q68G74 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LHX8Q68G74 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LHX8Q68G74 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LHX8Q68G74 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LHX8Q68G74 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LHX8Q68G74 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LHX8Q68G74 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LHX8Q68G74 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LHX8Q68G74 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LHX8Q68G74 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LHX8Q68G74 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LHX8Q68G74 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LHX8Q68G74 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LHX8Q68G74 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LHX8Q68G74 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LHX8Q68G74 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
LHX8Q68G74 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LHX8Q68G74 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LHX8Q68G74 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LHX8Q68G74 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LHX8Q68G74 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LHX8Q68G74 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LHX8Q68G74 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LHX8Q68G74 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LHX8Q68G74 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LHX8Q68G74 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LHX8Q68G74 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LHX8Q68G74 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LHX8Q68G74 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LHX8Q68G74 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LHX8Q68G74 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LHX8Q68G74 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LHX8Q68G74 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LHX8Q68G74 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LHX8Q68G74 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms