Protein–RNA interactions for Protein: Q5T124

UBXN11, UBX domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN11Q5T124 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBXN11Q5T124 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
UBXN11Q5T124 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
UBXN11Q5T124 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBXN11Q5T124 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBXN11Q5T124 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBXN11Q5T124 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBXN11Q5T124 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBXN11Q5T124 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBXN11Q5T124 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBXN11Q5T124 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBXN11Q5T124 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBXN11Q5T124 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBXN11Q5T124 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBXN11Q5T124 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBXN11Q5T124 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBXN11Q5T124 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBXN11Q5T124 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
UBXN11Q5T124 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBXN11Q5T124 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBXN11Q5T124 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBXN11Q5T124 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBXN11Q5T124 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBXN11Q5T124 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBXN11Q5T124 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBXN11Q5T124 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBXN11Q5T124 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBXN11Q5T124 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBXN11Q5T124 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBXN11Q5T124 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBXN11Q5T124 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBXN11Q5T124 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBXN11Q5T124 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBXN11Q5T124 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBXN11Q5T124 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBXN11Q5T124 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBXN11Q5T124 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBXN11Q5T124 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBXN11Q5T124 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBXN11Q5T124 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBXN11Q5T124 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBXN11Q5T124 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBXN11Q5T124 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBXN11Q5T124 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBXN11Q5T124 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBXN11Q5T124 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBXN11Q5T124 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBXN11Q5T124 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBXN11Q5T124 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
UBXN11Q5T124 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBXN11Q5T124 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBXN11Q5T124 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBXN11Q5T124 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBXN11Q5T124 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
UBXN11Q5T124 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBXN11Q5T124 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBXN11Q5T124 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBXN11Q5T124 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBXN11Q5T124 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
UBXN11Q5T124 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBXN11Q5T124 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBXN11Q5T124 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBXN11Q5T124 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBXN11Q5T124 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBXN11Q5T124 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBXN11Q5T124 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBXN11Q5T124 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBXN11Q5T124 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBXN11Q5T124 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBXN11Q5T124 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBXN11Q5T124 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBXN11Q5T124 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBXN11Q5T124 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBXN11Q5T124 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBXN11Q5T124 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBXN11Q5T124 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBXN11Q5T124 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBXN11Q5T124 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBXN11Q5T124 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBXN11Q5T124 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBXN11Q5T124 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
UBXN11Q5T124 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBXN11Q5T124 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
UBXN11Q5T124 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBXN11Q5T124 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBXN11Q5T124 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBXN11Q5T124 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBXN11Q5T124 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBXN11Q5T124 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBXN11Q5T124 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBXN11Q5T124 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBXN11Q5T124 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBXN11Q5T124 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBXN11Q5T124 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBXN11Q5T124 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
UBXN11Q5T124 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBXN11Q5T124 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBXN11Q5T124 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBXN11Q5T124 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBXN11Q5T124 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms