Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZG55

GREB1, Protein GREB1, humanhuman

Predictions only

Length 1,949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREB1Q4ZG55 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GREB1Q4ZG55 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GREB1Q4ZG55 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GREB1Q4ZG55 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GREB1Q4ZG55 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GREB1Q4ZG55 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GREB1Q4ZG55 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GREB1Q4ZG55 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GREB1Q4ZG55 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GREB1Q4ZG55 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GREB1Q4ZG55 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GREB1Q4ZG55 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GREB1Q4ZG55 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GREB1Q4ZG55 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GREB1Q4ZG55 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GREB1Q4ZG55 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GREB1Q4ZG55 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
GREB1Q4ZG55 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GREB1Q4ZG55 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GREB1Q4ZG55 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GREB1Q4ZG55 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GREB1Q4ZG55 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GREB1Q4ZG55 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GREB1Q4ZG55 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GREB1Q4ZG55 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GREB1Q4ZG55 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GREB1Q4ZG55 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GREB1Q4ZG55 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GREB1Q4ZG55 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GREB1Q4ZG55 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GREB1Q4ZG55 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GREB1Q4ZG55 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GREB1Q4ZG55 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GREB1Q4ZG55 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GREB1Q4ZG55 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GREB1Q4ZG55 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
GREB1Q4ZG55 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GREB1Q4ZG55 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GREB1Q4ZG55 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GREB1Q4ZG55 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GREB1Q4ZG55 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
GREB1Q4ZG55 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GREB1Q4ZG55 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GREB1Q4ZG55 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GREB1Q4ZG55 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GREB1Q4ZG55 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GREB1Q4ZG55 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GREB1Q4ZG55 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
GREB1Q4ZG55 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GREB1Q4ZG55 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GREB1Q4ZG55 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GREB1Q4ZG55 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GREB1Q4ZG55 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
GREB1Q4ZG55 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GREB1Q4ZG55 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
GREB1Q4ZG55 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GREB1Q4ZG55 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GREB1Q4ZG55 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GREB1Q4ZG55 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GREB1Q4ZG55 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GREB1Q4ZG55 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GREB1Q4ZG55 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GREB1Q4ZG55 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GREB1Q4ZG55 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GREB1Q4ZG55 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GREB1Q4ZG55 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GREB1Q4ZG55 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GREB1Q4ZG55 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GREB1Q4ZG55 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GREB1Q4ZG55 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GREB1Q4ZG55 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GREB1Q4ZG55 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GREB1Q4ZG55 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GREB1Q4ZG55 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GREB1Q4ZG55 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GREB1Q4ZG55 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GREB1Q4ZG55 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GREB1Q4ZG55 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GREB1Q4ZG55 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GREB1Q4ZG55 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GREB1Q4ZG55 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GREB1Q4ZG55 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GREB1Q4ZG55 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GREB1Q4ZG55 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GREB1Q4ZG55 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GREB1Q4ZG55 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GREB1Q4ZG55 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GREB1Q4ZG55 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GREB1Q4ZG55 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GREB1Q4ZG55 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GREB1Q4ZG55 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GREB1Q4ZG55 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GREB1Q4ZG55 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GREB1Q4ZG55 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GREB1Q4ZG55 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GREB1Q4ZG55 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GREB1Q4ZG55 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GREB1Q4ZG55 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GREB1Q4ZG55 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GREB1Q4ZG55 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms