Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL38Q2WGJ6 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL38Q2WGJ6 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL38Q2WGJ6 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL38Q2WGJ6 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL38Q2WGJ6 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL38Q2WGJ6 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL38Q2WGJ6 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL38Q2WGJ6 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL38Q2WGJ6 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL38Q2WGJ6 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL38Q2WGJ6 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL38Q2WGJ6 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL38Q2WGJ6 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL38Q2WGJ6 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL38Q2WGJ6 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL38Q2WGJ6 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL38Q2WGJ6 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL38Q2WGJ6 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL38Q2WGJ6 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL38Q2WGJ6 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL38Q2WGJ6 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL38Q2WGJ6 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL38Q2WGJ6 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL38Q2WGJ6 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL38Q2WGJ6 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL38Q2WGJ6 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL38Q2WGJ6 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL38Q2WGJ6 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL38Q2WGJ6 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL38Q2WGJ6 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL38Q2WGJ6 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL38Q2WGJ6 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL38Q2WGJ6 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL38Q2WGJ6 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL38Q2WGJ6 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL38Q2WGJ6 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL38Q2WGJ6 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL38Q2WGJ6 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL38Q2WGJ6 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL38Q2WGJ6 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL38Q2WGJ6 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL38Q2WGJ6 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL38Q2WGJ6 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL38Q2WGJ6 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL38Q2WGJ6 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL38Q2WGJ6 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL38Q2WGJ6 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL38Q2WGJ6 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL38Q2WGJ6 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL38Q2WGJ6 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL38Q2WGJ6 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL38Q2WGJ6 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL38Q2WGJ6 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL38Q2WGJ6 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL38Q2WGJ6 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL38Q2WGJ6 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL38Q2WGJ6 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL38Q2WGJ6 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL38Q2WGJ6 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL38Q2WGJ6 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL38Q2WGJ6 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL38Q2WGJ6 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL38Q2WGJ6 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL38Q2WGJ6 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL38Q2WGJ6 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL38Q2WGJ6 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL38Q2WGJ6 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL38Q2WGJ6 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL38Q2WGJ6 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL38Q2WGJ6 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL38Q2WGJ6 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL38Q2WGJ6 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
KLHL38Q2WGJ6 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
KLHL38Q2WGJ6 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
KLHL38Q2WGJ6 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
KLHL38Q2WGJ6 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
KLHL38Q2WGJ6 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL38Q2WGJ6 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL38Q2WGJ6 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL38Q2WGJ6 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL38Q2WGJ6 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL38Q2WGJ6 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL38Q2WGJ6 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL38Q2WGJ6 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL38Q2WGJ6 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL38Q2WGJ6 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL38Q2WGJ6 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL38Q2WGJ6 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL38Q2WGJ6 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL38Q2WGJ6 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL38Q2WGJ6 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL38Q2WGJ6 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL38Q2WGJ6 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL38Q2WGJ6 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL38Q2WGJ6 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL38Q2WGJ6 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KLHL38Q2WGJ6 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KLHL38Q2WGJ6 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
KLHL38Q2WGJ6 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms