Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CLPPQ16740 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CLPPQ16740 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CLPPQ16740 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CLPPQ16740 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CLPPQ16740 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CLPPQ16740 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CLPPQ16740 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CLPPQ16740 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CLPPQ16740 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CLPPQ16740 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CLPPQ16740 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CLPPQ16740 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CLPPQ16740 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CLPPQ16740 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CLPPQ16740 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CLPPQ16740 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CLPPQ16740 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CLPPQ16740 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CLPPQ16740 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CLPPQ16740 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CLPPQ16740 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CLPPQ16740 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CLPPQ16740 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CLPPQ16740 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CLPPQ16740 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CLPPQ16740 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CLPPQ16740 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CLPPQ16740 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CLPPQ16740 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CLPPQ16740 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CLPPQ16740 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CLPPQ16740 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLPPQ16740 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLPPQ16740 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLPPQ16740 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLPPQ16740 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLPPQ16740 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLPPQ16740 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLPPQ16740 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLPPQ16740 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLPPQ16740 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLPPQ16740 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLPPQ16740 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLPPQ16740 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLPPQ16740 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLPPQ16740 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLPPQ16740 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLPPQ16740 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLPPQ16740 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLPPQ16740 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLPPQ16740 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLPPQ16740 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLPPQ16740 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLPPQ16740 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLPPQ16740 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLPPQ16740 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLPPQ16740 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLPPQ16740 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLPPQ16740 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLPPQ16740 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CLPPQ16740 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLPPQ16740 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLPPQ16740 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLPPQ16740 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLPPQ16740 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLPPQ16740 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLPPQ16740 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CLPPQ16740 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CLPPQ16740 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CLPPQ16740 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLPPQ16740 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLPPQ16740 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLPPQ16740 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLPPQ16740 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLPPQ16740 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CLPPQ16740 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLPPQ16740 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLPPQ16740 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CLPPQ16740 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLPPQ16740 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLPPQ16740 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLPPQ16740 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLPPQ16740 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLPPQ16740 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CLPPQ16740 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20■□□□□ 0.79
CLPPQ16740 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLPPQ16740 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLPPQ16740 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLPPQ16740 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CLPPQ16740 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CLPPQ16740 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLPPQ16740 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CLPPQ16740 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLPPQ16740 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLPPQ16740 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLPPQ16740 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLPPQ16740 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLPPQ16740 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLPPQ16740 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms