Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNCBQ16143 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNCBQ16143 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNCBQ16143 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNCBQ16143 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNCBQ16143 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNCBQ16143 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNCBQ16143 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNCBQ16143 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNCBQ16143 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNCBQ16143 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNCBQ16143 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNCBQ16143 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNCBQ16143 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNCBQ16143 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNCBQ16143 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNCBQ16143 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNCBQ16143 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNCBQ16143 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNCBQ16143 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNCBQ16143 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNCBQ16143 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNCBQ16143 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNCBQ16143 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNCBQ16143 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNCBQ16143 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNCBQ16143 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNCBQ16143 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNCBQ16143 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNCBQ16143 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNCBQ16143 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNCBQ16143 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNCBQ16143 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNCBQ16143 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNCBQ16143 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNCBQ16143 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNCBQ16143 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNCBQ16143 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNCBQ16143 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNCBQ16143 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNCBQ16143 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNCBQ16143 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SNCBQ16143 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SNCBQ16143 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNCBQ16143 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNCBQ16143 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNCBQ16143 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNCBQ16143 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNCBQ16143 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNCBQ16143 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNCBQ16143 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNCBQ16143 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNCBQ16143 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNCBQ16143 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNCBQ16143 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNCBQ16143 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNCBQ16143 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNCBQ16143 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNCBQ16143 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNCBQ16143 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNCBQ16143 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNCBQ16143 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNCBQ16143 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNCBQ16143 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNCBQ16143 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNCBQ16143 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNCBQ16143 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNCBQ16143 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SNCBQ16143 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNCBQ16143 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNCBQ16143 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNCBQ16143 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNCBQ16143 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNCBQ16143 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
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SNCBQ16143 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNCBQ16143 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNCBQ16143 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNCBQ16143 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNCBQ16143 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNCBQ16143 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNCBQ16143 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNCBQ16143 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNCBQ16143 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNCBQ16143 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNCBQ16143 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNCBQ16143 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNCBQ16143 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNCBQ16143 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNCBQ16143 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNCBQ16143 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNCBQ16143 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNCBQ16143 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SNCBQ16143 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNCBQ16143 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNCBQ16143 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNCBQ16143 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNCBQ16143 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNCBQ16143 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
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