Protein–RNA interactions for Protein: Q15653

NFKBIB, NF-kappa-B inhibitor beta, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIBQ15653 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NFKBIBQ15653 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NFKBIBQ15653 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NFKBIBQ15653 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NFKBIBQ15653 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NFKBIBQ15653 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NFKBIBQ15653 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NFKBIBQ15653 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NFKBIBQ15653 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NFKBIBQ15653 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NFKBIBQ15653 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NFKBIBQ15653 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NFKBIBQ15653 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NFKBIBQ15653 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NFKBIBQ15653 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NFKBIBQ15653 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NFKBIBQ15653 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NFKBIBQ15653 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NFKBIBQ15653 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NFKBIBQ15653 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NFKBIBQ15653 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NFKBIBQ15653 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NFKBIBQ15653 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NFKBIBQ15653 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NFKBIBQ15653 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NFKBIBQ15653 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NFKBIBQ15653 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NFKBIBQ15653 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NFKBIBQ15653 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NFKBIBQ15653 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NFKBIBQ15653 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NFKBIBQ15653 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NFKBIBQ15653 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NFKBIBQ15653 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NFKBIBQ15653 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NFKBIBQ15653 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NFKBIBQ15653 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NFKBIBQ15653 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NFKBIBQ15653 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NFKBIBQ15653 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NFKBIBQ15653 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NFKBIBQ15653 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NFKBIBQ15653 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NFKBIBQ15653 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NFKBIBQ15653 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NFKBIBQ15653 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NFKBIBQ15653 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NFKBIBQ15653 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NFKBIBQ15653 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NFKBIBQ15653 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NFKBIBQ15653 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NFKBIBQ15653 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NFKBIBQ15653 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NFKBIBQ15653 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NFKBIBQ15653 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NFKBIBQ15653 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NFKBIBQ15653 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NFKBIBQ15653 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NFKBIBQ15653 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NFKBIBQ15653 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NFKBIBQ15653 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NFKBIBQ15653 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NFKBIBQ15653 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NFKBIBQ15653 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NFKBIBQ15653 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NFKBIBQ15653 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NFKBIBQ15653 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NFKBIBQ15653 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NFKBIBQ15653 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NFKBIBQ15653 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NFKBIBQ15653 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NFKBIBQ15653 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NFKBIBQ15653 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NFKBIBQ15653 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NFKBIBQ15653 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NFKBIBQ15653 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NFKBIBQ15653 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NFKBIBQ15653 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NFKBIBQ15653 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NFKBIBQ15653 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NFKBIBQ15653 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NFKBIBQ15653 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NFKBIBQ15653 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NFKBIBQ15653 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NFKBIBQ15653 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NFKBIBQ15653 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NFKBIBQ15653 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NFKBIBQ15653 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NFKBIBQ15653 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NFKBIBQ15653 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NFKBIBQ15653 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NFKBIBQ15653 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NFKBIBQ15653 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NFKBIBQ15653 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NFKBIBQ15653 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NFKBIBQ15653 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NFKBIBQ15653 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NFKBIBQ15653 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NFKBIBQ15653 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NFKBIBQ15653 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms