Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDE6HQ13956 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDE6HQ13956 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDE6HQ13956 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDE6HQ13956 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDE6HQ13956 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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PDE6HQ13956 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PDE6HQ13956 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDE6HQ13956 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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PDE6HQ13956 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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PDE6HQ13956 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDE6HQ13956 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDE6HQ13956 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDE6HQ13956 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDE6HQ13956 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDE6HQ13956 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDE6HQ13956 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDE6HQ13956 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDE6HQ13956 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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PDE6HQ13956 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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PDE6HQ13956 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
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PDE6HQ13956 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDE6HQ13956 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDE6HQ13956 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDE6HQ13956 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDE6HQ13956 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDE6HQ13956 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDE6HQ13956 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDE6HQ13956 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDE6HQ13956 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDE6HQ13956 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDE6HQ13956 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDE6HQ13956 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
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