Protein–RNA interactions for Protein: Q13829

TNFAIP1, BTB/POZ domain-containing adapter for CUL3-mediated RhoA degradation protein 2, humanhuman

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP1Q13829 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNFAIP1Q13829 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNFAIP1Q13829 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNFAIP1Q13829 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNFAIP1Q13829 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNFAIP1Q13829 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNFAIP1Q13829 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNFAIP1Q13829 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TNFAIP1Q13829 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TNFAIP1Q13829 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TNFAIP1Q13829 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TNFAIP1Q13829 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNFAIP1Q13829 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNFAIP1Q13829 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNFAIP1Q13829 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNFAIP1Q13829 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNFAIP1Q13829 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNFAIP1Q13829 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNFAIP1Q13829 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNFAIP1Q13829 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNFAIP1Q13829 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNFAIP1Q13829 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNFAIP1Q13829 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNFAIP1Q13829 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNFAIP1Q13829 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNFAIP1Q13829 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNFAIP1Q13829 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNFAIP1Q13829 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNFAIP1Q13829 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNFAIP1Q13829 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNFAIP1Q13829 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNFAIP1Q13829 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNFAIP1Q13829 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNFAIP1Q13829 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNFAIP1Q13829 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNFAIP1Q13829 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNFAIP1Q13829 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TNFAIP1Q13829 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TNFAIP1Q13829 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNFAIP1Q13829 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNFAIP1Q13829 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNFAIP1Q13829 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNFAIP1Q13829 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNFAIP1Q13829 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNFAIP1Q13829 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNFAIP1Q13829 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNFAIP1Q13829 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNFAIP1Q13829 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNFAIP1Q13829 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNFAIP1Q13829 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNFAIP1Q13829 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TNFAIP1Q13829 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNFAIP1Q13829 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNFAIP1Q13829 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNFAIP1Q13829 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNFAIP1Q13829 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNFAIP1Q13829 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNFAIP1Q13829 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNFAIP1Q13829 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNFAIP1Q13829 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNFAIP1Q13829 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNFAIP1Q13829 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNFAIP1Q13829 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNFAIP1Q13829 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNFAIP1Q13829 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNFAIP1Q13829 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNFAIP1Q13829 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNFAIP1Q13829 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNFAIP1Q13829 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TNFAIP1Q13829 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNFAIP1Q13829 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNFAIP1Q13829 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNFAIP1Q13829 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNFAIP1Q13829 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNFAIP1Q13829 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNFAIP1Q13829 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNFAIP1Q13829 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNFAIP1Q13829 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNFAIP1Q13829 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNFAIP1Q13829 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNFAIP1Q13829 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNFAIP1Q13829 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNFAIP1Q13829 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNFAIP1Q13829 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNFAIP1Q13829 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNFAIP1Q13829 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNFAIP1Q13829 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNFAIP1Q13829 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNFAIP1Q13829 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNFAIP1Q13829 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNFAIP1Q13829 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNFAIP1Q13829 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNFAIP1Q13829 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNFAIP1Q13829 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNFAIP1Q13829 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNFAIP1Q13829 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TNFAIP1Q13829 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNFAIP1Q13829 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNFAIP1Q13829 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNFAIP1Q13829 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
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