Protein–RNA interactions for Protein: Q13601

KRR1, KRR1 small subunit processome component homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRR1Q13601 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KRR1Q13601 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KRR1Q13601 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KRR1Q13601 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KRR1Q13601 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KRR1Q13601 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KRR1Q13601 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KRR1Q13601 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KRR1Q13601 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KRR1Q13601 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KRR1Q13601 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KRR1Q13601 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
KRR1Q13601 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
KRR1Q13601 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
KRR1Q13601 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC19■□□□□ 0.63
KRR1Q13601 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
KRR1Q13601 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
KRR1Q13601 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
KRR1Q13601 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC19■□□□□ 0.63
KRR1Q13601 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KRR1Q13601 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KRR1Q13601 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
KRR1Q13601 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KRR1Q13601 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KRR1Q13601 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KRR1Q13601 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KRR1Q13601 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KRR1Q13601 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KRR1Q13601 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KRR1Q13601 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KRR1Q13601 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KRR1Q13601 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KRR1Q13601 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KRR1Q13601 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KRR1Q13601 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRR1Q13601 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRR1Q13601 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRR1Q13601 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRR1Q13601 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRR1Q13601 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRR1Q13601 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRR1Q13601 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRR1Q13601 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRR1Q13601 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
KRR1Q13601 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRR1Q13601 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRR1Q13601 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRR1Q13601 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRR1Q13601 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRR1Q13601 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRR1Q13601 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRR1Q13601 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KRR1Q13601 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KRR1Q13601 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KRR1Q13601 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
KRR1Q13601 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KRR1Q13601 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KRR1Q13601 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KRR1Q13601 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
KRR1Q13601 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KRR1Q13601 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KRR1Q13601 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KRR1Q13601 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KRR1Q13601 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KRR1Q13601 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
KRR1Q13601 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KRR1Q13601 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KRR1Q13601 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KRR1Q13601 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KRR1Q13601 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KRR1Q13601 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KRR1Q13601 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KRR1Q13601 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KRR1Q13601 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KRR1Q13601 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KRR1Q13601 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KRR1Q13601 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KRR1Q13601 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KRR1Q13601 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KRR1Q13601 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KRR1Q13601 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KRR1Q13601 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KRR1Q13601 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KRR1Q13601 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KRR1Q13601 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KRR1Q13601 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KRR1Q13601 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KRR1Q13601 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KRR1Q13601 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KRR1Q13601 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KRR1Q13601 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KRR1Q13601 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KRR1Q13601 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KRR1Q13601 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KRR1Q13601 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KRR1Q13601 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KRR1Q13601 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KRR1Q13601 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KRR1Q13601 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KRR1Q13601 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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