Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRPF4BQ13523 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRPF4BQ13523 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
PRPF4BQ13523 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRPF4BQ13523 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRPF4BQ13523 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRPF4BQ13523 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRPF4BQ13523 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRPF4BQ13523 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRPF4BQ13523 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRPF4BQ13523 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRPF4BQ13523 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PRPF4BQ13523 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PRPF4BQ13523 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRPF4BQ13523 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRPF4BQ13523 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRPF4BQ13523 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRPF4BQ13523 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRPF4BQ13523 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRPF4BQ13523 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRPF4BQ13523 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PRPF4BQ13523 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRPF4BQ13523 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRPF4BQ13523 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRPF4BQ13523 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRPF4BQ13523 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRPF4BQ13523 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRPF4BQ13523 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRPF4BQ13523 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRPF4BQ13523 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRPF4BQ13523 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PRPF4BQ13523 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRPF4BQ13523 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PRPF4BQ13523 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRPF4BQ13523 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRPF4BQ13523 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRPF4BQ13523 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRPF4BQ13523 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRPF4BQ13523 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRPF4BQ13523 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPF4BQ13523 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPF4BQ13523 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPF4BQ13523 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPF4BQ13523 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPF4BQ13523 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPF4BQ13523 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPF4BQ13523 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPF4BQ13523 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPF4BQ13523 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPF4BQ13523 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPF4BQ13523 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPF4BQ13523 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPF4BQ13523 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPF4BQ13523 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPF4BQ13523 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPF4BQ13523 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPF4BQ13523 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPF4BQ13523 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPF4BQ13523 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPF4BQ13523 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRPF4BQ13523 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRPF4BQ13523 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRPF4BQ13523 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRPF4BQ13523 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRPF4BQ13523 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PRPF4BQ13523 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PRPF4BQ13523 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRPF4BQ13523 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRPF4BQ13523 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRPF4BQ13523 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRPF4BQ13523 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRPF4BQ13523 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRPF4BQ13523 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRPF4BQ13523 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPF4BQ13523 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPF4BQ13523 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPF4BQ13523 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPF4BQ13523 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPF4BQ13523 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPF4BQ13523 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPF4BQ13523 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPF4BQ13523 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPF4BQ13523 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPF4BQ13523 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPF4BQ13523 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPF4BQ13523 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPF4BQ13523 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPF4BQ13523 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRPF4BQ13523 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRPF4BQ13523 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRPF4BQ13523 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRPF4BQ13523 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRPF4BQ13523 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRPF4BQ13523 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRPF4BQ13523 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRPF4BQ13523 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRPF4BQ13523 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRPF4BQ13523 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRPF4BQ13523 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRPF4BQ13523 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms