Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXE3Q13461 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXE3Q13461 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXE3Q13461 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXE3Q13461 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXE3Q13461 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXE3Q13461 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXE3Q13461 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXE3Q13461 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXE3Q13461 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXE3Q13461 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXE3Q13461 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXE3Q13461 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXE3Q13461 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXE3Q13461 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXE3Q13461 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXE3Q13461 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXE3Q13461 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXE3Q13461 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXE3Q13461 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXE3Q13461 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXE3Q13461 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXE3Q13461 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXE3Q13461 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXE3Q13461 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXE3Q13461 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXE3Q13461 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXE3Q13461 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXE3Q13461 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXE3Q13461 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXE3Q13461 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXE3Q13461 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXE3Q13461 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXE3Q13461 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXE3Q13461 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXE3Q13461 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXE3Q13461 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXE3Q13461 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXE3Q13461 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXE3Q13461 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXE3Q13461 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXE3Q13461 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXE3Q13461 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXE3Q13461 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXE3Q13461 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXE3Q13461 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXE3Q13461 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXE3Q13461 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXE3Q13461 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXE3Q13461 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXE3Q13461 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXE3Q13461 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXE3Q13461 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXE3Q13461 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXE3Q13461 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXE3Q13461 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXE3Q13461 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXE3Q13461 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXE3Q13461 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXE3Q13461 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXE3Q13461 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXE3Q13461 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXE3Q13461 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXE3Q13461 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXE3Q13461 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXE3Q13461 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXE3Q13461 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXE3Q13461 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXE3Q13461 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXE3Q13461 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXE3Q13461 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXE3Q13461 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXE3Q13461 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXE3Q13461 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXE3Q13461 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXE3Q13461 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXE3Q13461 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXE3Q13461 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXE3Q13461 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXE3Q13461 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXE3Q13461 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXE3Q13461 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXE3Q13461 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXE3Q13461 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXE3Q13461 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXE3Q13461 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXE3Q13461 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXE3Q13461 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXE3Q13461 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXE3Q13461 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXE3Q13461 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXE3Q13461 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXE3Q13461 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXE3Q13461 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXE3Q13461 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXE3Q13461 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXE3Q13461 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXE3Q13461 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXE3Q13461 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXE3Q13461 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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