Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MSLNQ13421 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
MSLNQ13421 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MSLNQ13421 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MSLNQ13421 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MSLNQ13421 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
MSLNQ13421 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MSLNQ13421 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MSLNQ13421 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MSLNQ13421 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MSLNQ13421 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MSLNQ13421 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MSLNQ13421 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MSLNQ13421 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MSLNQ13421 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MSLNQ13421 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MSLNQ13421 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
MSLNQ13421 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MSLNQ13421 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MSLNQ13421 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MSLNQ13421 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MSLNQ13421 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MSLNQ13421 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MSLNQ13421 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MSLNQ13421 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MSLNQ13421 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
MSLNQ13421 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MSLNQ13421 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MSLNQ13421 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MSLNQ13421 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MSLNQ13421 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MSLNQ13421 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MSLNQ13421 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MSLNQ13421 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MSLNQ13421 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MSLNQ13421 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MSLNQ13421 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
MSLNQ13421 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MSLNQ13421 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
MSLNQ13421 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MSLNQ13421 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
MSLNQ13421 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MSLNQ13421 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MSLNQ13421 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MSLNQ13421 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MSLNQ13421 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MSLNQ13421 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MSLNQ13421 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MSLNQ13421 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MSLNQ13421 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MSLNQ13421 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
MSLNQ13421 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MSLNQ13421 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MSLNQ13421 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MSLNQ13421 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MSLNQ13421 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MSLNQ13421 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MSLNQ13421 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MSLNQ13421 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MSLNQ13421 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MSLNQ13421 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MSLNQ13421 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MSLNQ13421 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MSLNQ13421 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MSLNQ13421 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MSLNQ13421 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
MSLNQ13421 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MSLNQ13421 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MSLNQ13421 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MSLNQ13421 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MSLNQ13421 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MSLNQ13421 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MSLNQ13421 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MSLNQ13421 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MSLNQ13421 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MSLNQ13421 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MSLNQ13421 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MSLNQ13421 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MSLNQ13421 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MSLNQ13421 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MSLNQ13421 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MSLNQ13421 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
MSLNQ13421 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MSLNQ13421 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MSLNQ13421 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MSLNQ13421 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MSLNQ13421 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MSLNQ13421 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MSLNQ13421 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MSLNQ13421 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MSLNQ13421 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MSLNQ13421 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MSLNQ13421 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MSLNQ13421 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MSLNQ13421 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MSLNQ13421 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MSLNQ13421 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MSLNQ13421 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MSLNQ13421 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MSLNQ13421 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
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