Protein–RNA interactions for Protein: Q12457

NSI1, RNA polymerase I termination factor, yeastyeast

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NSI1Q12457 VPS73YGL104C 1461 nt4.1□□□□□ -1.75
NSI1Q12457 SCY1YGL083W 2415 nt4.1□□□□□ -1.75
NSI1Q12457 GPI8YDR331W 1236 nt4.09□□□□□ -1.75
NSI1Q12457 YGL042CYGL042C 306 nt4.09□□□□□ -1.75
NSI1Q12457 YLR428CYLR428C 345 nt4.09□□□□□ -1.75
NSI1Q12457 YLR466C-BYLR466C-B 117 nt4.09□□□□□ -1.75
NSI1Q12457 YPR059CYPR059C 387 nt4.09□□□□□ -1.75
NSI1Q12457 MNT4YNR059W 1743 nt4.09□□□□□ -1.76
NSI1Q12457 YDL199CYDL199C 2064 nt4.09□□□□□ -1.76
NSI1Q12457 SPT16YGL207W 3108 nt4.08□□□□□ -1.76
NSI1Q12457 SNA4YDL123W 423 nt4.08□□□□□ -1.76
NSI1Q12457 YDR526CYDR526C 471 nt4.08□□□□□ -1.76
NSI1Q12457 YER023C-AYER023C-A 213 nt4.08□□□□□ -1.76
NSI1Q12457 YHR139C-AYHR139C-A 312 nt4.08□□□□□ -1.76
NSI1Q12457 PAM16YJL104W 450 nt4.08□□□□□ -1.76
NSI1Q12457 SIN4YNL236W 2925 nt4.08□□□□□ -1.76
NSI1Q12457 IDH2YOR136W 1110 nt4.08□□□□□ -1.76
NSI1Q12457 YCL023CYCL023C 348 nt4.08□□□□□ -1.76
NSI1Q12457 DAP2YHR028C 2457 nt4.07□□□□□ -1.76
NSI1Q12457 YJL132WYJL132W 2253 nt4.07□□□□□ -1.76
NSI1Q12457 NUP85YJR042W 2235 nt4.07□□□□□ -1.76
NSI1Q12457 LYP1YNL268W 1836 nt4.07□□□□□ -1.76
NSI1Q12457 VEL1YGL258W 621 nt4.07□□□□□ -1.76
NSI1Q12457 YAL004WYAL004W 648 nt4.07□□□□□ -1.76
NSI1Q12457 FCF2YLR051C 654 nt4.07□□□□□ -1.76
NSI1Q12457 RPL6BYLR448W 531 nt4.07□□□□□ -1.76
NSI1Q12457 TIR2YOR010C 756 nt4.07□□□□□ -1.76
NSI1Q12457 BIL1YOR304C-A 231 nt4.07□□□□□ -1.76
NSI1Q12457 YPL025CYPL025C 558 nt4.07□□□□□ -1.76
NSI1Q12457 ECM22YLR228C 2445 nt4.07□□□□□ -1.76
NSI1Q12457 TCO89YPL180W 2400 nt4.07□□□□□ -1.76
NSI1Q12457 YOL019WYOL019W 1656 nt4.06□□□□□ -1.76
NSI1Q12457 FRT2YAL028W 1587 nt4.06□□□□□ -1.76
NSI1Q12457 PPZ1YML016C 2079 nt4.06□□□□□ -1.76
NSI1Q12457 CDC36YDL165W 576 nt4.06□□□□□ -1.76
NSI1Q12457 CAJ1YER048C 1176 nt4.06□□□□□ -1.76
NSI1Q12457 tL(UAG)JtL(UAG)J 82 nt4.06□□□□□ -1.76
NSI1Q12457 tL(UAG)L1tL(UAG)L1 82 nt4.06□□□□□ -1.76
NSI1Q12457 tL(UAG)L2tL(UAG)L2 82 nt4.06□□□□□ -1.76
NSI1Q12457 YGL188C-AYGL188C-A 141 nt4.06□□□□□ -1.76
NSI1Q12457 tQ(UUG)CtQ(UUG)C 72 nt4.06□□□□□ -1.76
NSI1Q12457 tQ(UUG)D1tQ(UUG)D1 72 nt4.06□□□□□ -1.76
NSI1Q12457 tQ(UUG)D2tQ(UUG)D2 72 nt4.06□□□□□ -1.76
NSI1Q12457 tQ(UUG)D3tQ(UUG)D3 72 nt4.06□□□□□ -1.76
NSI1Q12457 tQ(UUG)E1tQ(UUG)E1 72 nt4.06□□□□□ -1.76
NSI1Q12457 tQ(UUG)HtQ(UUG)H 72 nt4.06□□□□□ -1.76
NSI1Q12457 tQ(UUG)LtQ(UUG)L 72 nt4.06□□□□□ -1.76
NSI1Q12457 RPS4AYJR145C 786 nt4.06□□□□□ -1.76
NSI1Q12457 YLR302CYLR302C 363 nt4.06□□□□□ -1.76
NSI1Q12457 TSC3YBR058C-A 243 nt4.06□□□□□ -1.76
NSI1Q12457 YPR136CYPR136C 513 nt4.06□□□□□ -1.76
NSI1Q12457 MDM36YPR083W 1740 nt4.06□□□□□ -1.76
NSI1Q12457 JHD2YJR119C 2187 nt4.05□□□□□ -1.76
NSI1Q12457 ATP5YDR298C 639 nt4.05□□□□□ -1.76
NSI1Q12457 ISD11YER048W-A 285 nt4.05□□□□□ -1.76
NSI1Q12457 APQ12YIL040W 417 nt4.05□□□□□ -1.76
NSI1Q12457 FMP46YKR049C 402 nt4.05□□□□□ -1.76
NSI1Q12457 SSN8YNL025C 972 nt4.05□□□□□ -1.76
NSI1Q12457 YOR170WYOR170W 306 nt4.05□□□□□ -1.76
NSI1Q12457 YOR385WYOR385W 873 nt4.05□□□□□ -1.76
NSI1Q12457 snR35snR35 204 nt4.05□□□□□ -1.76
NSI1Q12457 YNL193WYNL193W 1677 nt4.05□□□□□ -1.76
NSI1Q12457 RPG1YBR079C 2895 nt4.05□□□□□ -1.76
NSI1Q12457 VMA1YDL185W 3216 nt4.05□□□□□ -1.76
NSI1Q12457 PAC1YOR269W 1485 nt4.05□□□□□ -1.76
NSI1Q12457 UTP25YIL091C 2166 nt4.04□□□□□ -1.76
NSI1Q12457 KIP3YGL216W 2418 nt4.04□□□□□ -1.76
NSI1Q12457 HOS3YPL116W 2094 nt4.04□□□□□ -1.76
NSI1Q12457 HSP30YCR021C 999 nt4.04□□□□□ -1.76
NSI1Q12457 HUB1YNR032C-A 222 nt4.04□□□□□ -1.76
NSI1Q12457 YPR077CYPR077C 372 nt4.04□□□□□ -1.76
NSI1Q12457 DPB3YBR278W 606 nt4.04□□□□□ -1.76
NSI1Q12457 RIA1YNL163C 3333 nt4.04□□□□□ -1.76
NSI1Q12457 PMT6YGR199W 2280 nt4.04□□□□□ -1.76
NSI1Q12457 DSF2YBR007C 2211 nt4.03□□□□□ -1.76
NSI1Q12457 TPA1YER049W 1935 nt4.03□□□□□ -1.76
NSI1Q12457 FUN12YAL035W 3009 nt4.03□□□□□ -1.76
NSI1Q12457 PHM7YOL084W 2976 nt4.03□□□□□ -1.76
NSI1Q12457 EXO70YJL085W 1872 nt4.03□□□□□ -1.76
NSI1Q12457 GCR1YPL075W 2358 nt4.03□□□□□ -1.76
NSI1Q12457 SNF2YOR290C 5112 nt4.03□□□□□ -1.76
NSI1Q12457 YDL094CYDL094C 510 nt4.03□□□□□ -1.76
NSI1Q12457 YGL152CYGL152C 678 nt4.03□□□□□ -1.76
NSI1Q12457 YIL171WYIL171W 330 nt4.03□□□□□ -1.76
NSI1Q12457 INN1YNL152W 1230 nt4.03□□□□□ -1.76
NSI1Q12457 SUI1YNL244C 327 nt4.03□□□□□ -1.76
NSI1Q12457 INO4YOL108C 456 nt4.03□□□□□ -1.76
NSI1Q12457 PIS1YPR113W 663 nt4.03□□□□□ -1.76
NSI1Q12457 HDA2YDR295C 2025 nt4.02□□□□□ -1.77
NSI1Q12457 DIE2YGR227W 1578 nt4.02□□□□□ -1.77
NSI1Q12457 FLO8YER109C 2400 nt4.02□□□□□ -1.77
NSI1Q12457 YRM1YOR172W 2361 nt4.02□□□□□ -1.77
NSI1Q12457 OAF3YKR064W 2592 nt4.02□□□□□ -1.77
NSI1Q12457 RPS8BYER102W 603 nt4.02□□□□□ -1.77
NSI1Q12457 MVB12YGR206W 306 nt4.02□□□□□ -1.77
NSI1Q12457 RPS4BYHR203C 786 nt4.02□□□□□ -1.77
NSI1Q12457 CWC24YLR323C 780 nt4.02□□□□□ -1.77
NSI1Q12457 YNL170WYNL170W 396 nt4.02□□□□□ -1.77
NSI1Q12457 snR13snR13 124 nt4.02□□□□□ -1.77
NSI1Q12457 NDC80YIL144W 2076 nt4.02□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 31.5 ms