Protein–RNA interactions for Protein: Q12377

RPN6, 26S proteasome regulatory subunit RPN6, yeastyeast

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPN6Q12377 YKU80YMR106C 1890 nt2.43□□□□□ -2.02
RPN6Q12377 PDR1YGL013C 3207 nt2.43□□□□□ -2.02
RPN6Q12377 URK1YNR012W 1506 nt2.42□□□□□ -2.02
RPN6Q12377 RGR1YLR071C 3249 nt2.42□□□□□ -2.02
RPN6Q12377 TOP2YNL088W 4287 nt2.42□□□□□ -2.02
RPN6Q12377 tC(GCA)BtC(GCA)B 72 nt2.42□□□□□ -2.02
RPN6Q12377 tC(GCA)GtC(GCA)G 72 nt2.42□□□□□ -2.02
RPN6Q12377 tC(GCA)P1tC(GCA)P1 72 nt2.42□□□□□ -2.02
RPN6Q12377 tC(GCA)P2tC(GCA)P2 72 nt2.42□□□□□ -2.02
RPN6Q12377 THG1YGR024C 714 nt2.42□□□□□ -2.02
RPN6Q12377 BAT1YHR208W 1182 nt2.42□□□□□ -2.02
RPN6Q12377 YIL054WYIL054W 318 nt2.42□□□□□ -2.02
RPN6Q12377 LIP2YLR239C 987 nt2.42□□□□□ -2.02
RPN6Q12377 RPS12YOR369C 432 nt2.42□□□□□ -2.02
RPN6Q12377 SMY2YBR172C 2223 nt2.42□□□□□ -2.02
RPN6Q12377 YDR261W-AYDR261W-A 1317 nt2.42□□□□□ -2.02
RPN6Q12377 VPS38YLR360W 1320 nt2.42□□□□□ -2.02
RPN6Q12377 SAK1YER129W 3429 nt2.41□□□□□ -2.02
RPN6Q12377 NSE4YDL105W 1209 nt2.41□□□□□ -2.02
RPN6Q12377 ATX1YNL259C 222 nt2.41□□□□□ -2.02
RPN6Q12377 CSI2YOL007C 1026 nt2.41□□□□□ -2.02
RPN6Q12377 YOR055WYOR055W 435 nt2.41□□□□□ -2.02
RPN6Q12377 GRX5YPL059W 453 nt2.41□□□□□ -2.02
RPN6Q12377 YBR287WYBR287W 1284 nt2.41□□□□□ -2.02
RPN6Q12377 TRA1YHR099W 11235 nt2.41□□□□□ -2.02
RPN6Q12377 FKS3YMR306W 5358 nt2.41□□□□□ -2.02
RPN6Q12377 MLH1YMR167W 2310 nt2.4□□□□□ -2.02
RPN6Q12377 APC11YDL008W 498 nt2.4□□□□□ -2.03
RPN6Q12377 YDR262WYDR262W 819 nt2.4□□□□□ -2.03
RPN6Q12377 STE2YFL026W 1296 nt2.4□□□□□ -2.03
RPN6Q12377 LOC1YFR001W 615 nt2.4□□□□□ -2.03
RPN6Q12377 YGR115CYGR115C 780 nt2.4□□□□□ -2.03
RPN6Q12377 YLL044WYLL044W 447 nt2.4□□□□□ -2.03
RPN6Q12377 MST28YAR033W 705 nt2.4□□□□□ -2.03
RPN6Q12377 PAI3YMR174C 207 nt2.4□□□□□ -2.03
RPN6Q12377 KTI11YBL071W-A 249 nt2.4□□□□□ -2.03
RPN6Q12377 YOL107WYOL107W 1029 nt2.4□□□□□ -2.03
RPN6Q12377 YPL276WYPL276W 438 nt2.4□□□□□ -2.03
RPN6Q12377 MBA1YBR185C 837 nt2.4□□□□□ -2.03
RPN6Q12377 RAD18YCR066W 1464 nt2.39□□□□□ -2.03
RPN6Q12377 PSD2YGR170W 3417 nt2.39□□□□□ -2.03
RPN6Q12377 RSE1YML049C 4086 nt2.39□□□□□ -2.03
RPN6Q12377 YDR338CYDR338C 2088 nt2.39□□□□□ -2.03
RPN6Q12377 UBC13YDR092W 462 nt2.39□□□□□ -2.03
RPN6Q12377 YGR293CYGR293C 462 nt2.39□□□□□ -2.03
RPN6Q12377 SPO11YHL022C 1197 nt2.39□□□□□ -2.03
RPN6Q12377 YHR032W-AYHR032W-A 180 nt2.39□□□□□ -2.03
RPN6Q12377 LIN1YHR156C 1023 nt2.39□□□□□ -2.03
RPN6Q12377 PEX18YHR160C 852 nt2.39□□□□□ -2.03
RPN6Q12377 YHR213WYHR213W 597 nt2.39□□□□□ -2.03
RPN6Q12377 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.39□□□□□ -2.03
RPN6Q12377 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.39□□□□□ -2.03
RPN6Q12377 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.39□□□□□ -2.03
RPN6Q12377 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.39□□□□□ -2.03
RPN6Q12377 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.39□□□□□ -2.03
RPN6Q12377 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.39□□□□□ -2.03
RPN6Q12377 YIR036W-AYIR036W-A 402 nt2.39□□□□□ -2.03
RPN6Q12377 YJL156W-AYJL156W-A 222 nt2.39□□□□□ -2.03
RPN6Q12377 GPI14YJR013W 1212 nt2.39□□□□□ -2.03
RPN6Q12377 YJR020WYJR020W 333 nt2.39□□□□□ -2.03
RPN6Q12377 YAR062WYAR062W 597 nt2.39□□□□□ -2.03
RPN6Q12377 SME1YOR159C 285 nt2.39□□□□□ -2.03
RPN6Q12377 RRD2YPL152W 1077 nt2.39□□□□□ -2.03
RPN6Q12377 PTP3YER075C 2787 nt2.39□□□□□ -2.03
RPN6Q12377 MAL33YBR297W 1407 nt2.39□□□□□ -2.03
RPN6Q12377 SPF1YEL031W 3648 nt2.38□□□□□ -2.03
RPN6Q12377 UTP15YMR093W 1542 nt2.38□□□□□ -2.03
RPN6Q12377 PHO2YDL106C 1680 nt2.38□□□□□ -2.03
RPN6Q12377 YOL057WYOL057W 2136 nt2.38□□□□□ -2.03
RPN6Q12377 SAE2YGL175C 1038 nt2.38□□□□□ -2.03
RPN6Q12377 RPL11BYGR085C 525 nt2.38□□□□□ -2.03
RPN6Q12377 YLR154W-EYLR154W-E 204 nt2.38□□□□□ -2.03
RPN6Q12377 SIR3YLR442C 2937 nt2.38□□□□□ -2.03
RPN6Q12377 PRE8YML092C 753 nt2.38□□□□□ -2.03
RPN6Q12377 YOR050CYOR050C 348 nt2.38□□□□□ -2.03
RPN6Q12377 SEN54YPL083C 1404 nt2.38□□□□□ -2.03
RPN6Q12377 ORC2YBR060C 1863 nt2.38□□□□□ -2.03
RPN6Q12377 RPL11AYPR102C 525 nt2.38□□□□□ -2.03
RPN6Q12377 PIS1YPR113W 663 nt2.38□□□□□ -2.03
RPN6Q12377 LST4YKL176C 2487 nt2.37□□□□□ -2.03
RPN6Q12377 YCR013CYCR013C 648 nt2.37□□□□□ -2.03
RPN6Q12377 snR83snR83 306 nt2.37□□□□□ -2.03
RPN6Q12377 MIC19YFR011C 513 nt2.37□□□□□ -2.03
RPN6Q12377 PCL5YHR071W 690 nt2.37□□□□□ -2.03
RPN6Q12377 EST3YIL009C-A 546 nt2.37□□□□□ -2.03
RPN6Q12377 YIL012WYIL012W 342 nt2.37□□□□□ -2.03
RPN6Q12377 RRT16YNL105W 429 nt2.37□□□□□ -2.03
RPN6Q12377 RRG7YOR305W 729 nt2.37□□□□□ -2.03
RPN6Q12377 YPL119C-AYPL119C-A 264 nt2.37□□□□□ -2.03
RPN6Q12377 SEC66YBR171W 621 nt2.37□□□□□ -2.03
RPN6Q12377 SWR1YDR334W 4545 nt2.37□□□□□ -2.03
RPN6Q12377 YBL005W-BYBL005W-B 5268 nt2.37□□□□□ -2.03
RPN6Q12377 TMA64YDR117C 1698 nt2.37□□□□□ -2.03
RPN6Q12377 STI1YOR027W 1770 nt2.36□□□□□ -2.03
RPN6Q12377 YEF3YLR249W 3135 nt2.36□□□□□ -2.03
RPN6Q12377 SNA4YDL123W 423 nt2.36□□□□□ -2.03
RPN6Q12377 YER158W-AYER158W-A 216 nt2.36□□□□□ -2.03
RPN6Q12377 COX3Q0275 810 nt2.36□□□□□ -2.03
RPN6Q12377 HEM4YOR278W 828 nt2.36□□□□□ -2.03
RPN6Q12377 ATP3YBR039W 936 nt2.36□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 63.6 ms