Protein–RNA interactions for Protein: Q12060

HFI1, Transcriptional coactivator HFI1/ADA1, yeastyeast

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HFI1Q12060 ALA1YOR335C 2877 nt3.53□□□□□ -1.85
HFI1Q12060 MAL33YBR297W 1407 nt3.53□□□□□ -1.85
HFI1Q12060 DBF20YPR111W 1695 nt3.52□□□□□ -1.85
HFI1Q12060 BI4Q0120 1917 nt3.52□□□□□ -1.85
HFI1Q12060 YKL222CYKL222C 2118 nt3.52□□□□□ -1.85
HFI1Q12060 HEF3YNL014W 3135 nt3.52□□□□□ -1.85
HFI1Q12060 YDR157WYDR157W 402 nt3.52□□□□□ -1.85
HFI1Q12060 YDR442WYDR442W 393 nt3.52□□□□□ -1.85
HFI1Q12060 YDR526CYDR526C 471 nt3.52□□□□□ -1.85
HFI1Q12060 YER119C-AYER119C-A 372 nt3.52□□□□□ -1.85
HFI1Q12060 BI2Q0110 1272 nt3.52□□□□□ -1.85
HFI1Q12060 LIF1YGL090W 1266 nt3.52□□□□□ -1.85
HFI1Q12060 YAP3YHL009C 993 nt3.52□□□□□ -1.85
HFI1Q12060 RPI1YIL119C 1224 nt3.52□□□□□ -1.85
HFI1Q12060 IGO1YNL157W 507 nt3.52□□□□□ -1.85
HFI1Q12060 snR42snR42 351 nt3.52□□□□□ -1.85
HFI1Q12060 SYT1YPR095C 3681 nt3.52□□□□□ -1.85
HFI1Q12060 RAD26YJR035W 3258 nt3.52□□□□□ -1.85
HFI1Q12060 KHA1YJL094C 2622 nt3.51□□□□□ -1.85
HFI1Q12060 PWP2YCR057C 2772 nt3.51□□□□□ -1.85
HFI1Q12060 YDL009CYDL009C 324 nt3.51□□□□□ -1.85
HFI1Q12060 tF(GAA)DtF(GAA)D 73 nt3.51□□□□□ -1.85
HFI1Q12060 tF(GAA)NtF(GAA)N 73 nt3.51□□□□□ -1.85
HFI1Q12060 YER084W-AYER084W-A 513 nt3.51□□□□□ -1.85
HFI1Q12060 tR(ACG)Q2tR(ACG)Q2 74 nt3.51□□□□□ -1.85
HFI1Q12060 YJL127C-BYJL127C-B 159 nt3.51□□□□□ -1.85
HFI1Q12060 APC9YLR102C 798 nt3.51□□□□□ -1.85
HFI1Q12060 CTK3YML112W 891 nt3.51□□□□□ -1.85
HFI1Q12060 YNR021WYNR021W 1215 nt3.51□□□□□ -1.85
HFI1Q12060 YPR050CYPR050C 414 nt3.51□□□□□ -1.85
HFI1Q12060 REG1YDR028C 3045 nt3.51□□□□□ -1.85
HFI1Q12060 XRS2YDR369C 2565 nt3.51□□□□□ -1.85
HFI1Q12060 BYE1YKL005C 1785 nt3.51□□□□□ -1.85
HFI1Q12060 SSP1YHR184W 1716 nt3.5□□□□□ -1.85
HFI1Q12060 SKN7YHR206W 1869 nt3.5□□□□□ -1.85
HFI1Q12060 CEP3YMR168C 1827 nt3.5□□□□□ -1.85
HFI1Q12060 MIX14YDR031W 366 nt3.5□□□□□ -1.85
HFI1Q12060 RPB9YGL070C 369 nt3.5□□□□□ -1.85
HFI1Q12060 ECL1YGR146C 636 nt3.5□□□□□ -1.85
HFI1Q12060 DAD2YKR083C 402 nt3.5□□□□□ -1.85
HFI1Q12060 SRL3YKR091W 741 nt3.5□□□□□ -1.85
HFI1Q12060 HHF2YNL030W 312 nt3.5□□□□□ -1.85
HFI1Q12060 ATG3YNR007C 933 nt3.5□□□□□ -1.85
HFI1Q12060 PFY1YOR122C 381 nt3.5□□□□□ -1.85
HFI1Q12060 CAT5YOR125C 702 nt3.5□□□□□ -1.85
HFI1Q12060 YPR012WYPR012W 255 nt3.5□□□□□ -1.85
HFI1Q12060 TIM12YBR091C 330 nt3.5□□□□□ -1.85
HFI1Q12060 STP2YHR006W 1626 nt3.5□□□□□ -1.85
HFI1Q12060 MSH2YOL090W 2895 nt3.5□□□□□ -1.85
HFI1Q12060 SKP2YNL311C 2292 nt3.5□□□□□ -1.85
HFI1Q12060 PBS2YJL128C 2007 nt3.49□□□□□ -1.85
HFI1Q12060 YHR080CYHR080C 4038 nt3.49□□□□□ -1.85
HFI1Q12060 STU1YBL034C 4542 nt3.49□□□□□ -1.85
HFI1Q12060 YCR090CYCR090C 549 nt3.49□□□□□ -1.85
HFI1Q12060 YDR114CYDR114C 303 nt3.49□□□□□ -1.85
HFI1Q12060 YER091C-AYER091C-A 222 nt3.49□□□□□ -1.85
HFI1Q12060 tV(CAC)DtV(CAC)D 73 nt3.49□□□□□ -1.85
HFI1Q12060 tV(CAC)HtV(CAC)H 73 nt3.49□□□□□ -1.85
HFI1Q12060 DFG10YIL049W 762 nt3.49□□□□□ -1.85
HFI1Q12060 YLR297WYLR297W 390 nt3.49□□□□□ -1.85
HFI1Q12060 RHO5YNL180C 996 nt3.49□□□□□ -1.85
HFI1Q12060 DBP10YDL031W 2988 nt3.49□□□□□ -1.85
HFI1Q12060 REC8YPR007C 2043 nt3.49□□□□□ -1.85
HFI1Q12060 PHO81YGR233C 3537 nt3.49□□□□□ -1.85
HFI1Q12060 ZDS2YML109W 2829 nt3.48□□□□□ -1.85
HFI1Q12060 NTO1YPR031W 2247 nt3.48□□□□□ -1.85
HFI1Q12060 ETP1YHL010C 1758 nt3.48□□□□□ -1.85
HFI1Q12060 YGR242WYGR242W 309 nt3.48□□□□□ -1.85
HFI1Q12060 HRI1YLR301W 735 nt3.48□□□□□ -1.85
HFI1Q12060 DDR48YMR173W 1293 nt3.48□□□□□ -1.85
HFI1Q12060 YOL085W-AYOL085W-A 213 nt3.48□□□□□ -1.85
HFI1Q12060 OST2YOR103C 393 nt3.48□□□□□ -1.85
HFI1Q12060 RRG8YPR116W 834 nt3.48□□□□□ -1.85
HFI1Q12060 RPS23BYPR132W 438 nt3.48□□□□□ -1.85
HFI1Q12060 ARR2YPR200C 393 nt3.48□□□□□ -1.85
HFI1Q12060 YBR209WYBR209W 318 nt3.48□□□□□ -1.85
HFI1Q12060 URB2YJR041C 3525 nt3.48□□□□□ -1.85
HFI1Q12060 YTA7YGR270W 4140 nt3.48□□□□□ -1.85
HFI1Q12060 SLP1YOR154W 1764 nt3.48□□□□□ -1.85
HFI1Q12060 MNT3YIL014W 1893 nt3.47□□□□□ -1.85
HFI1Q12060 PSF1YDR013W 627 nt3.47□□□□□ -1.85
HFI1Q12060 RTR2YDR066C 591 nt3.47□□□□□ -1.85
HFI1Q12060 YDR118W-AYDR118W-A 117 nt3.47□□□□□ -1.85
HFI1Q12060 YLR334CYLR334C 381 nt3.47□□□□□ -1.85
HFI1Q12060 SEN15YMR059W 387 nt3.47□□□□□ -1.85
HFI1Q12060 GOT1YMR292W 417 nt3.47□□□□□ -1.85
HFI1Q12060 YNL046WYNL046W 519 nt3.47□□□□□ -1.85
HFI1Q12060 RIO2YNL207W 1278 nt3.47□□□□□ -1.85
HFI1Q12060 RPL23AYBL087C 414 nt3.47□□□□□ -1.85
HFI1Q12060 SSF2YDR312W 1362 nt3.47□□□□□ -1.85
HFI1Q12060 RPA135YPR010C 3612 nt3.47□□□□□ -1.85
HFI1Q12060 CHS3YBR023C 3498 nt3.47□□□□□ -1.85
HFI1Q12060 JIP5YPR169W 1479 nt3.47□□□□□ -1.85
HFI1Q12060 MYO5YMR109W 3660 nt3.47□□□□□ -1.85
HFI1Q12060 YOR296WYOR296W 3870 nt3.46□□□□□ -1.85
HFI1Q12060 SIZ1YDR409W 2715 nt3.46□□□□□ -1.86
HFI1Q12060 STU2YLR045C 2667 nt3.46□□□□□ -1.86
HFI1Q12060 AHC2YCR082W 387 nt3.46□□□□□ -1.86
HFI1Q12060 PPH3YDR075W 927 nt3.46□□□□□ -1.86
HFI1Q12060 ECO1YFR027W 846 nt3.46□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 59.9 ms