Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IFFO1Q0D2I5 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
IFFO1Q0D2I5 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
IFFO1Q0D2I5 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IFFO1Q0D2I5 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IFFO1Q0D2I5 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.3■■□□□ 1
IFFO1Q0D2I5 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IFFO1Q0D2I5 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IFFO1Q0D2I5 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IFFO1Q0D2I5 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IFFO1Q0D2I5 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
IFFO1Q0D2I5 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.29■■□□□ 1
IFFO1Q0D2I5 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IFFO1Q0D2I5 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IFFO1Q0D2I5 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IFFO1Q0D2I5 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IFFO1Q0D2I5 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IFFO1Q0D2I5 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IFFO1Q0D2I5 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
IFFO1Q0D2I5 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.29■■□□□ 1
IFFO1Q0D2I5 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
IFFO1Q0D2I5 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.29■■□□□ 1
IFFO1Q0D2I5 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IFFO1Q0D2I5 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IFFO1Q0D2I5 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IFFO1Q0D2I5 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IFFO1Q0D2I5 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IFFO1Q0D2I5 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IFFO1Q0D2I5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IFFO1Q0D2I5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
IFFO1Q0D2I5 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IFFO1Q0D2I5 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
IFFO1Q0D2I5 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
IFFO1Q0D2I5 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IFFO1Q0D2I5 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IFFO1Q0D2I5 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
IFFO1Q0D2I5 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IFFO1Q0D2I5 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IFFO1Q0D2I5 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
IFFO1Q0D2I5 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IFFO1Q0D2I5 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.28■■□□□ 1
IFFO1Q0D2I5 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.28■■□□□ 1
IFFO1Q0D2I5 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
IFFO1Q0D2I5 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
IFFO1Q0D2I5 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.28■■□□□ 1
IFFO1Q0D2I5 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IFFO1Q0D2I5 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
IFFO1Q0D2I5 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
IFFO1Q0D2I5 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IFFO1Q0D2I5 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IFFO1Q0D2I5 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
IFFO1Q0D2I5 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
IFFO1Q0D2I5 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IFFO1Q0D2I5 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
IFFO1Q0D2I5 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
IFFO1Q0D2I5 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IFFO1Q0D2I5 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
IFFO1Q0D2I5 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IFFO1Q0D2I5 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
IFFO1Q0D2I5 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
IFFO1Q0D2I5 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
IFFO1Q0D2I5 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
IFFO1Q0D2I5 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
IFFO1Q0D2I5 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IFFO1Q0D2I5 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
IFFO1Q0D2I5 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
IFFO1Q0D2I5 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
IFFO1Q0D2I5 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.27■□□□□ 0.99
IFFO1Q0D2I5 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFFO1Q0D2I5 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFFO1Q0D2I5 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFFO1Q0D2I5 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFFO1Q0D2I5 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFFO1Q0D2I5 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFFO1Q0D2I5 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFFO1Q0D2I5 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFFO1Q0D2I5 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFFO1Q0D2I5 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFFO1Q0D2I5 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFFO1Q0D2I5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFFO1Q0D2I5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFFO1Q0D2I5 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFFO1Q0D2I5 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFFO1Q0D2I5 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFFO1Q0D2I5 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFFO1Q0D2I5 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IFFO1Q0D2I5 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IFFO1Q0D2I5 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IFFO1Q0D2I5 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IFFO1Q0D2I5 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IFFO1Q0D2I5 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IFFO1Q0D2I5 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IFFO1Q0D2I5 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IFFO1Q0D2I5 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IFFO1Q0D2I5 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IFFO1Q0D2I5 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IFFO1Q0D2I5 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IFFO1Q0D2I5 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IFFO1Q0D2I5 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IFFO1Q0D2I5 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms