Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM27E3Q08E93 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM27E3Q08E93 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM27E3Q08E93 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM27E3Q08E93 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM27E3Q08E93 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM27E3Q08E93 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM27E3Q08E93 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM27E3Q08E93 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM27E3Q08E93 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM27E3Q08E93 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM27E3Q08E93 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM27E3Q08E93 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM27E3Q08E93 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM27E3Q08E93 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM27E3Q08E93 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM27E3Q08E93 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM27E3Q08E93 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM27E3Q08E93 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM27E3Q08E93 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM27E3Q08E93 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM27E3Q08E93 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM27E3Q08E93 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM27E3Q08E93 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM27E3Q08E93 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM27E3Q08E93 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM27E3Q08E93 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM27E3Q08E93 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM27E3Q08E93 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM27E3Q08E93 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM27E3Q08E93 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM27E3Q08E93 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM27E3Q08E93 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM27E3Q08E93 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM27E3Q08E93 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM27E3Q08E93 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM27E3Q08E93 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM27E3Q08E93 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM27E3Q08E93 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM27E3Q08E93 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM27E3Q08E93 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM27E3Q08E93 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM27E3Q08E93 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM27E3Q08E93 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM27E3Q08E93 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM27E3Q08E93 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM27E3Q08E93 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM27E3Q08E93 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM27E3Q08E93 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM27E3Q08E93 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM27E3Q08E93 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM27E3Q08E93 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM27E3Q08E93 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM27E3Q08E93 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM27E3Q08E93 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM27E3Q08E93 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM27E3Q08E93 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM27E3Q08E93 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM27E3Q08E93 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM27E3Q08E93 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM27E3Q08E93 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM27E3Q08E93 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM27E3Q08E93 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM27E3Q08E93 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM27E3Q08E93 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM27E3Q08E93 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM27E3Q08E93 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM27E3Q08E93 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM27E3Q08E93 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM27E3Q08E93 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM27E3Q08E93 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM27E3Q08E93 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM27E3Q08E93 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM27E3Q08E93 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM27E3Q08E93 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
FAM27E3Q08E93 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
FAM27E3Q08E93 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FAM27E3Q08E93 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FAM27E3Q08E93 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
FAM27E3Q08E93 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM27E3Q08E93 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM27E3Q08E93 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM27E3Q08E93 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM27E3Q08E93 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM27E3Q08E93 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM27E3Q08E93 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM27E3Q08E93 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM27E3Q08E93 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM27E3Q08E93 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM27E3Q08E93 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM27E3Q08E93 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM27E3Q08E93 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM27E3Q08E93 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM27E3Q08E93 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM27E3Q08E93 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM27E3Q08E93 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM27E3Q08E93 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM27E3Q08E93 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM27E3Q08E93 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM27E3Q08E93 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms