Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EGR3Q06889 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EGR3Q06889 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EGR3Q06889 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EGR3Q06889 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EGR3Q06889 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EGR3Q06889 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EGR3Q06889 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EGR3Q06889 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
EGR3Q06889 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EGR3Q06889 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EGR3Q06889 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
EGR3Q06889 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EGR3Q06889 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EGR3Q06889 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EGR3Q06889 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
EGR3Q06889 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EGR3Q06889 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EGR3Q06889 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EGR3Q06889 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EGR3Q06889 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EGR3Q06889 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EGR3Q06889 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EGR3Q06889 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EGR3Q06889 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EGR3Q06889 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EGR3Q06889 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EGR3Q06889 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
EGR3Q06889 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EGR3Q06889 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EGR3Q06889 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
EGR3Q06889 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EGR3Q06889 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EGR3Q06889 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EGR3Q06889 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EGR3Q06889 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EGR3Q06889 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EGR3Q06889 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EGR3Q06889 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EGR3Q06889 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EGR3Q06889 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EGR3Q06889 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EGR3Q06889 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EGR3Q06889 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EGR3Q06889 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EGR3Q06889 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EGR3Q06889 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EGR3Q06889 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EGR3Q06889 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EGR3Q06889 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
EGR3Q06889 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EGR3Q06889 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EGR3Q06889 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EGR3Q06889 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
EGR3Q06889 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EGR3Q06889 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EGR3Q06889 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EGR3Q06889 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
EGR3Q06889 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EGR3Q06889 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EGR3Q06889 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EGR3Q06889 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EGR3Q06889 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EGR3Q06889 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EGR3Q06889 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EGR3Q06889 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EGR3Q06889 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EGR3Q06889 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EGR3Q06889 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EGR3Q06889 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EGR3Q06889 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EGR3Q06889 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EGR3Q06889 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EGR3Q06889 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EGR3Q06889 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EGR3Q06889 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EGR3Q06889 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EGR3Q06889 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EGR3Q06889 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EGR3Q06889 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EGR3Q06889 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EGR3Q06889 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EGR3Q06889 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EGR3Q06889 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EGR3Q06889 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
EGR3Q06889 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EGR3Q06889 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
EGR3Q06889 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EGR3Q06889 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EGR3Q06889 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EGR3Q06889 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EGR3Q06889 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EGR3Q06889 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EGR3Q06889 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EGR3Q06889 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EGR3Q06889 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EGR3Q06889 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EGR3Q06889 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EGR3Q06889 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EGR3Q06889 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms