Protein–RNA interactions for Protein: P78357

CNTNAP1, Contactin-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP1P78357 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNTNAP1P78357 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNTNAP1P78357 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNTNAP1P78357 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNTNAP1P78357 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNTNAP1P78357 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNTNAP1P78357 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNTNAP1P78357 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNTNAP1P78357 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNTNAP1P78357 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNTNAP1P78357 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNTNAP1P78357 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNTNAP1P78357 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNTNAP1P78357 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNTNAP1P78357 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CNTNAP1P78357 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNTNAP1P78357 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CNTNAP1P78357 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CNTNAP1P78357 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNTNAP1P78357 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNTNAP1P78357 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNTNAP1P78357 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CNTNAP1P78357 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CNTNAP1P78357 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CNTNAP1P78357 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CNTNAP1P78357 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CNTNAP1P78357 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CNTNAP1P78357 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNTNAP1P78357 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNTNAP1P78357 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNTNAP1P78357 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNTNAP1P78357 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNTNAP1P78357 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNTNAP1P78357 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNTNAP1P78357 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNTNAP1P78357 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNTNAP1P78357 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNTNAP1P78357 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNTNAP1P78357 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNTNAP1P78357 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNTNAP1P78357 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNTNAP1P78357 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNTNAP1P78357 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNTNAP1P78357 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNTNAP1P78357 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNTNAP1P78357 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNTNAP1P78357 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNTNAP1P78357 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CNTNAP1P78357 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNTNAP1P78357 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNTNAP1P78357 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNTNAP1P78357 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNTNAP1P78357 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNTNAP1P78357 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNTNAP1P78357 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNTNAP1P78357 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNTNAP1P78357 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNTNAP1P78357 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNTNAP1P78357 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNTNAP1P78357 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNTNAP1P78357 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNTNAP1P78357 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNTNAP1P78357 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNTNAP1P78357 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNTNAP1P78357 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNTNAP1P78357 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNTNAP1P78357 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CNTNAP1P78357 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CNTNAP1P78357 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNTNAP1P78357 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CNTNAP1P78357 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CNTNAP1P78357 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNTNAP1P78357 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNTNAP1P78357 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNTNAP1P78357 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNTNAP1P78357 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNTNAP1P78357 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNTNAP1P78357 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNTNAP1P78357 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CNTNAP1P78357 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNTNAP1P78357 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNTNAP1P78357 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNTNAP1P78357 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CNTNAP1P78357 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNTNAP1P78357 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNTNAP1P78357 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNTNAP1P78357 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNTNAP1P78357 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNTNAP1P78357 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNTNAP1P78357 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNTNAP1P78357 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNTNAP1P78357 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNTNAP1P78357 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNTNAP1P78357 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNTNAP1P78357 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNTNAP1P78357 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNTNAP1P78357 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNTNAP1P78357 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CNTNAP1P78357 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNTNAP1P78357 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms