Protein–RNA interactions for Protein: P55771

PAX9, Paired box protein Pax-9, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX9P55771 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PAX9P55771 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PAX9P55771 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PAX9P55771 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PAX9P55771 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PAX9P55771 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PAX9P55771 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PAX9P55771 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PAX9P55771 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PAX9P55771 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PAX9P55771 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PAX9P55771 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PAX9P55771 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PAX9P55771 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PAX9P55771 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PAX9P55771 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PAX9P55771 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PAX9P55771 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PAX9P55771 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PAX9P55771 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PAX9P55771 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PAX9P55771 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PAX9P55771 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PAX9P55771 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PAX9P55771 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PAX9P55771 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PAX9P55771 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PAX9P55771 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PAX9P55771 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PAX9P55771 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PAX9P55771 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PAX9P55771 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PAX9P55771 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PAX9P55771 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PAX9P55771 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PAX9P55771 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PAX9P55771 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PAX9P55771 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PAX9P55771 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PAX9P55771 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PAX9P55771 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PAX9P55771 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PAX9P55771 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PAX9P55771 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PAX9P55771 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PAX9P55771 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PAX9P55771 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PAX9P55771 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PAX9P55771 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PAX9P55771 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PAX9P55771 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PAX9P55771 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PAX9P55771 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PAX9P55771 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PAX9P55771 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PAX9P55771 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PAX9P55771 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PAX9P55771 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PAX9P55771 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PAX9P55771 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PAX9P55771 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PAX9P55771 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PAX9P55771 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PAX9P55771 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PAX9P55771 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PAX9P55771 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PAX9P55771 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PAX9P55771 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PAX9P55771 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PAX9P55771 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PAX9P55771 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PAX9P55771 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PAX9P55771 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PAX9P55771 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PAX9P55771 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PAX9P55771 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PAX9P55771 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PAX9P55771 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PAX9P55771 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PAX9P55771 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PAX9P55771 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PAX9P55771 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PAX9P55771 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PAX9P55771 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PAX9P55771 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PAX9P55771 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PAX9P55771 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PAX9P55771 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PAX9P55771 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PAX9P55771 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PAX9P55771 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PAX9P55771 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PAX9P55771 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PAX9P55771 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PAX9P55771 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PAX9P55771 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PAX9P55771 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PAX9P55771 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PAX9P55771 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PAX9P55771 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms