Protein–RNA interactions for Protein: P55199

ELL, RNA polymerase II elongation factor ELL, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELLP55199 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ELLP55199 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ELLP55199 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ELLP55199 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ELLP55199 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ELLP55199 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ELLP55199 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ELLP55199 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ELLP55199 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ELLP55199 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ELLP55199 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ELLP55199 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ELLP55199 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ELLP55199 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ELLP55199 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ELLP55199 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ELLP55199 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ELLP55199 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ELLP55199 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ELLP55199 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ELLP55199 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ELLP55199 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ELLP55199 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ELLP55199 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ELLP55199 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ELLP55199 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
ELLP55199 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ELLP55199 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ELLP55199 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ELLP55199 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ELLP55199 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ELLP55199 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ELLP55199 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ELLP55199 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ELLP55199 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ELLP55199 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ELLP55199 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ELLP55199 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ELLP55199 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ELLP55199 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ELLP55199 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ELLP55199 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ELLP55199 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ELLP55199 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ELLP55199 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ELLP55199 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ELLP55199 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ELLP55199 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ELLP55199 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ELLP55199 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ELLP55199 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ELLP55199 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ELLP55199 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ELLP55199 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ELLP55199 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ELLP55199 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ELLP55199 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ELLP55199 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ELLP55199 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ELLP55199 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ELLP55199 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ELLP55199 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ELLP55199 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ELLP55199 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ELLP55199 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ELLP55199 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ELLP55199 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ELLP55199 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ELLP55199 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ELLP55199 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ELLP55199 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ELLP55199 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ELLP55199 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ELLP55199 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ELLP55199 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ELLP55199 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ELLP55199 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ELLP55199 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ELLP55199 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ELLP55199 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ELLP55199 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ELLP55199 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ELLP55199 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ELLP55199 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ELLP55199 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ELLP55199 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ELLP55199 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ELLP55199 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ELLP55199 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ELLP55199 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ELLP55199 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ELLP55199 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ELLP55199 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ELLP55199 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ELLP55199 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ELLP55199 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ELLP55199 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ELLP55199 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ELLP55199 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ELLP55199 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms