Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOSBP53539 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOSBP53539 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOSBP53539 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOSBP53539 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOSBP53539 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOSBP53539 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
FOSBP53539 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOSBP53539 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOSBP53539 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOSBP53539 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOSBP53539 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOSBP53539 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOSBP53539 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOSBP53539 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
FOSBP53539 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOSBP53539 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOSBP53539 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOSBP53539 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOSBP53539 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOSBP53539 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOSBP53539 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
FOSBP53539 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOSBP53539 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOSBP53539 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOSBP53539 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOSBP53539 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOSBP53539 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
FOSBP53539 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FOSBP53539 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FOSBP53539 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FOSBP53539 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
FOSBP53539 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FOSBP53539 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
FOSBP53539 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FOSBP53539 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FOSBP53539 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FOSBP53539 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FOSBP53539 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FOSBP53539 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
FOSBP53539 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FOSBP53539 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FOSBP53539 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
FOSBP53539 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FOSBP53539 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FOSBP53539 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FOSBP53539 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOSBP53539 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOSBP53539 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOSBP53539 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOSBP53539 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOSBP53539 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOSBP53539 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOSBP53539 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOSBP53539 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOSBP53539 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOSBP53539 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOSBP53539 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOSBP53539 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOSBP53539 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOSBP53539 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOSBP53539 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOSBP53539 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
FOSBP53539 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
FOSBP53539 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOSBP53539 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOSBP53539 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOSBP53539 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOSBP53539 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOSBP53539 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOSBP53539 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOSBP53539 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOSBP53539 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOSBP53539 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOSBP53539 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOSBP53539 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOSBP53539 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOSBP53539 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOSBP53539 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOSBP53539 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
FOSBP53539 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOSBP53539 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOSBP53539 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOSBP53539 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOSBP53539 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOSBP53539 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOSBP53539 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOSBP53539 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOSBP53539 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOSBP53539 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOSBP53539 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOSBP53539 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOSBP53539 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
FOSBP53539 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOSBP53539 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOSBP53539 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOSBP53539 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
FOSBP53539 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOSBP53539 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOSBP53539 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms