Protein–RNA interactions for Protein: P42336

PIK3CA, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CAP42336 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PIK3CAP42336 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PIK3CAP42336 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PIK3CAP42336 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PIK3CAP42336 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PIK3CAP42336 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PIK3CAP42336 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PIK3CAP42336 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PIK3CAP42336 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PIK3CAP42336 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PIK3CAP42336 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PIK3CAP42336 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PIK3CAP42336 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PIK3CAP42336 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PIK3CAP42336 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PIK3CAP42336 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PIK3CAP42336 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PIK3CAP42336 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PIK3CAP42336 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PIK3CAP42336 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PIK3CAP42336 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PIK3CAP42336 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PIK3CAP42336 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PIK3CAP42336 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PIK3CAP42336 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PIK3CAP42336 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PIK3CAP42336 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PIK3CAP42336 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PIK3CAP42336 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PIK3CAP42336 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PIK3CAP42336 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PIK3CAP42336 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PIK3CAP42336 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PIK3CAP42336 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PIK3CAP42336 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PIK3CAP42336 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PIK3CAP42336 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIK3CAP42336 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIK3CAP42336 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIK3CAP42336 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIK3CAP42336 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIK3CAP42336 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIK3CAP42336 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIK3CAP42336 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIK3CAP42336 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIK3CAP42336 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIK3CAP42336 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIK3CAP42336 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PIK3CAP42336 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIK3CAP42336 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIK3CAP42336 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIK3CAP42336 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIK3CAP42336 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIK3CAP42336 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PIK3CAP42336 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PIK3CAP42336 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PIK3CAP42336 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PIK3CAP42336 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PIK3CAP42336 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PIK3CAP42336 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PIK3CAP42336 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PIK3CAP42336 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PIK3CAP42336 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PIK3CAP42336 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PIK3CAP42336 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PIK3CAP42336 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PIK3CAP42336 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PIK3CAP42336 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PIK3CAP42336 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PIK3CAP42336 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PIK3CAP42336 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PIK3CAP42336 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PIK3CAP42336 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PIK3CAP42336 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PIK3CAP42336 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PIK3CAP42336 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PIK3CAP42336 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIK3CAP42336 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIK3CAP42336 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIK3CAP42336 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIK3CAP42336 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIK3CAP42336 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIK3CAP42336 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIK3CAP42336 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIK3CAP42336 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIK3CAP42336 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PIK3CAP42336 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PIK3CAP42336 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIK3CAP42336 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIK3CAP42336 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIK3CAP42336 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIK3CAP42336 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIK3CAP42336 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIK3CAP42336 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIK3CAP42336 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PIK3CAP42336 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PIK3CAP42336 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PIK3CAP42336 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PIK3CAP42336 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PIK3CAP42336 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms