Protein–RNA interactions for Protein: P40818

USP8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP8P40818 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP8P40818 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
USP8P40818 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP8P40818 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP8P40818 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP8P40818 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP8P40818 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP8P40818 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP8P40818 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP8P40818 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP8P40818 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP8P40818 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
USP8P40818 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP8P40818 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP8P40818 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP8P40818 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP8P40818 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP8P40818 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP8P40818 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP8P40818 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP8P40818 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP8P40818 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP8P40818 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP8P40818 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP8P40818 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP8P40818 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP8P40818 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP8P40818 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP8P40818 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
USP8P40818 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP8P40818 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP8P40818 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP8P40818 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP8P40818 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP8P40818 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
USP8P40818 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP8P40818 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP8P40818 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP8P40818 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP8P40818 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP8P40818 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP8P40818 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP8P40818 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP8P40818 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP8P40818 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP8P40818 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP8P40818 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP8P40818 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP8P40818 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP8P40818 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP8P40818 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP8P40818 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP8P40818 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP8P40818 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP8P40818 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP8P40818 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP8P40818 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP8P40818 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP8P40818 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP8P40818 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP8P40818 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP8P40818 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP8P40818 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP8P40818 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP8P40818 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP8P40818 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP8P40818 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP8P40818 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP8P40818 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP8P40818 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP8P40818 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
USP8P40818 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP8P40818 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP8P40818 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP8P40818 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP8P40818 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP8P40818 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP8P40818 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP8P40818 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP8P40818 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP8P40818 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP8P40818 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP8P40818 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP8P40818 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP8P40818 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP8P40818 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP8P40818 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP8P40818 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP8P40818 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
USP8P40818 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP8P40818 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP8P40818 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP8P40818 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP8P40818 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP8P40818 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP8P40818 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP8P40818 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP8P40818 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP8P40818 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP8P40818 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms