Protein–RNA interactions for Protein: P33897

ABCD1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD1P33897 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCD1P33897 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCD1P33897 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCD1P33897 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCD1P33897 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCD1P33897 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCD1P33897 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCD1P33897 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCD1P33897 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCD1P33897 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCD1P33897 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCD1P33897 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCD1P33897 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCD1P33897 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCD1P33897 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCD1P33897 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCD1P33897 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCD1P33897 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCD1P33897 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCD1P33897 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCD1P33897 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCD1P33897 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ABCD1P33897 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCD1P33897 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCD1P33897 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCD1P33897 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCD1P33897 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCD1P33897 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCD1P33897 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCD1P33897 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCD1P33897 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCD1P33897 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCD1P33897 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCD1P33897 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCD1P33897 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCD1P33897 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCD1P33897 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCD1P33897 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCD1P33897 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCD1P33897 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCD1P33897 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCD1P33897 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCD1P33897 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCD1P33897 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCD1P33897 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCD1P33897 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCD1P33897 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCD1P33897 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCD1P33897 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCD1P33897 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCD1P33897 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCD1P33897 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCD1P33897 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCD1P33897 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCD1P33897 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCD1P33897 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCD1P33897 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCD1P33897 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCD1P33897 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCD1P33897 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCD1P33897 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCD1P33897 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCD1P33897 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCD1P33897 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCD1P33897 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCD1P33897 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCD1P33897 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCD1P33897 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCD1P33897 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCD1P33897 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCD1P33897 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCD1P33897 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCD1P33897 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCD1P33897 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCD1P33897 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCD1P33897 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCD1P33897 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCD1P33897 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCD1P33897 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCD1P33897 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCD1P33897 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCD1P33897 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCD1P33897 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCD1P33897 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCD1P33897 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCD1P33897 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCD1P33897 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCD1P33897 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCD1P33897 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCD1P33897 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCD1P33897 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCD1P33897 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCD1P33897 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCD1P33897 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCD1P33897 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCD1P33897 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCD1P33897 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCD1P33897 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCD1P33897 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABCD1P33897 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms