Protein–RNA interactions for Protein: P32578

SIP1, SNF1 protein kinase subunit beta-1, yeast

Predictions only

Length 815 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SIP1	P32578	STP2	YHR006W	1626 nt		3.11	□□□□□ -1.91
SIP1	P32578	POL2	YNL262W	6669 nt		3.11	□□□□□ -1.91
SIP1	P32578	AIM7	YDR063W	450 nt		3.11	□□□□□ -1.91
SIP1	P32578	YER066C-A	YER066C-A	501 nt		3.11	□□□□□ -1.91
SIP1	P32578	COQ5	YML110C	924 nt		3.11	□□□□□ -1.91
SIP1	P32578	MRPL3	YMR024W	1173 nt		3.11	□□□□□ -1.91
SIP1	P32578	AIM36	YMR157C	768 nt		3.11	□□□□□ -1.91
SIP1	P32578	RIO2	YNL207W	1278 nt		3.11	□□□□□ -1.91
SIP1	P32578	FRT2	YAL028W	1587 nt		3.11	□□□□□ -1.91
SIP1	P32578	IOC3	YFR013W	2364 nt		3.11	□□□□□ -1.91
SIP1	P32578	PFK26	YIL107C	2484 nt		3.11	□□□□□ -1.91
SIP1	P32578	SIZ1	YDR409W	2715 nt		3.1	□□□□□ -1.91
SIP1	P32578	AAD3	YCR107W	1092 nt		3.1	□□□□□ -1.91
SIP1	P32578	HUR1	YGL168W	333 nt		3.1	□□□□□ -1.91
SIP1	P32578	DFG10	YIL049W	762 nt		3.1	□□□□□ -1.91
SIP1	P32578	YIR040C	YIR040C	333 nt		3.1	□□□□□ -1.91
SIP1	P32578	AIM29	YKR074W	468 nt		3.1	□□□□□ -1.91
SIP1	P32578	YMR001C-A	YMR001C-A	231 nt		3.1	□□□□□ -1.91
SIP1	P32578	YPL261C	YPL261C	309 nt		3.1	□□□□□ -1.91
SIP1	P32578	SRB4	YER022W	2064 nt		3.1	□□□□□ -1.91
SIP1	P32578	STN1	YDR082W	1485 nt		3.09	□□□□□ -1.91
SIP1	P32578	REG1	YDR028C	3045 nt		3.09	□□□□□ -1.91
SIP1	P32578	MAK5	YBR142W	2322 nt		3.09	□□□□□ -1.91
SIP1	P32578	RSC1	YGR056W	2787 nt		3.09	□□□□□ -1.91
SIP1	P32578	MIT1	YEL007W	2001 nt		3.09	□□□□□ -1.91
SIP1	P32578	PPQ1	YPL179W	1650 nt		3.09	□□□□□ -1.91
SIP1	P32578	CWH41	YGL027C	2502 nt		3.09	□□□□□ -1.91
SIP1	P32578	ROD1	YOR018W	2514 nt		3.09	□□□□□ -1.91
SIP1	P32578	YDL228C	YDL228C	642 nt		3.09	□□□□□ -1.91
SIP1	P32578	YDR524W-C	YDR524W-C	90 nt		3.09	□□□□□ -1.91
SIP1	P32578	ERV1	YGR029W	570 nt		3.09	□□□□□ -1.91
SIP1	P32578	BIG1	YHR101C	1008 nt		3.09	□□□□□ -1.91
SIP1	P32578	MCR1	YKL150W	909 nt		3.09	□□□□□ -1.91
SIP1	P32578	YLR154C-H	YLR154C-H	132 nt		3.09	□□□□□ -1.91
SIP1	P32578	YLR156C-A	YLR156C-A	132 nt		3.09	□□□□□ -1.91
SIP1	P32578	YLR157C-C	YLR157C-C	132 nt		3.09	□□□□□ -1.91
SIP1	P32578	YLR159C-A	YLR159C-A	132 nt		3.09	□□□□□ -1.91
SIP1	P32578	DDR48	YMR173W	1293 nt		3.09	□□□□□ -1.91
SIP1	P32578	YNL179C	YNL179C	438 nt		3.09	□□□□□ -1.91
SIP1	P32578	GYL1	YMR192W	2163 nt		3.09	□□□□□ -1.91
SIP1	P32578	EMP70	YLR083C	2004 nt		3.09	□□□□□ -1.92
SIP1	P32578	PKH1	YDR490C	2301 nt		3.08	□□□□□ -1.92
SIP1	P32578	ECL1	YGR146C	636 nt		3.08	□□□□□ -1.92
SIP1	P32578	RPS0A	YGR214W	759 nt		3.08	□□□□□ -1.92
SIP1	P32578	YHL046W-A	YHL046W-A	327 nt		3.08	□□□□□ -1.92
SIP1	P32578	SDP1	YIL113W	630 nt		3.08	□□□□□ -1.92
SIP1	P32578	YJL127C-B	YJL127C-B	159 nt		3.08	□□□□□ -1.92
SIP1	P32578	YML108W	YML108W	318 nt		3.08	□□□□□ -1.92
SIP1	P32578	YNL181W	YNL181W	1224 nt		3.08	□□□□□ -1.92
SIP1	P32578	GIS2	YNL255C	462 nt		3.08	□□□□□ -1.92
SIP1	P32578	CAT5	YOR125C	702 nt		3.08	□□□□□ -1.92
SIP1	P32578	YPR108W-A	YPR108W-A	213 nt		3.08	□□□□□ -1.92
SIP1	P32578	NOG1	YPL093W	1944 nt		3.08	□□□□□ -1.92
SIP1	P32578	ENA5	YDR038C	3276 nt		3.08	□□□□□ -1.92
SIP1	P32578	ENA2	YDR039C	3276 nt		3.08	□□□□□ -1.92
SIP1	P32578	ENA1	YDR040C	3276 nt		3.08	□□□□□ -1.92
SIP1	P32578	KHA1	YJL094C	2622 nt		3.08	□□□□□ -1.92
SIP1	P32578	BNI4	YNL233W	2679 nt		3.08	□□□□□ -1.92
SIP1	P32578	SSF2	YDR312W	1362 nt		3.08	□□□□□ -1.92
SIP1	P32578	BCH1	YMR237W	2175 nt		3.08	□□□□□ -1.92
SIP1	P32578	VAC8	YEL013W	1737 nt		3.07	□□□□□ -1.92
SIP1	P32578	PBS2	YJL128C	2007 nt		3.07	□□□□□ -1.92
SIP1	P32578	YCG1	YDR325W	3108 nt		3.07	□□□□□ -1.92
SIP1	P32578	RPS14A	YCR031C	414 nt		3.07	□□□□□ -1.92
SIP1	P32578	IES5	YER092W	378 nt		3.07	□□□□□ -1.92
SIP1	P32578	RTS3	YGR161C	792 nt		3.07	□□□□□ -1.92
SIP1	P32578	PXR1	YGR280C	816 nt		3.07	□□□□□ -1.92
SIP1	P32578	OTU2	YHL013C	924 nt		3.07	□□□□□ -1.92
SIP1	P32578	YBL010C	YBL010C	843 nt		3.07	□□□□□ -1.92
SIP1	P32578	RPL19A	YBR084C-A	570 nt		3.07	□□□□□ -1.92
SIP1	P32578	YBR209W	YBR209W	318 nt		3.07	□□□□□ -1.92
SIP1	P32578	CWH43	YCR017C	2862 nt		3.07	□□□□□ -1.92
SIP1	P32578	YCK2	YNL154C	1641 nt		3.07	□□□□□ -1.92
SIP1	P32578	JEN1	YKL217W	1851 nt		3.07	□□□□□ -1.92
SIP1	P32578	UBP5	YER144C	2418 nt		3.07	□□□□□ -1.92
SIP1	P32578	RPN1	YHR027C	2982 nt		3.06	□□□□□ -1.92
SIP1	P32578	MAK21	YDR060W	3078 nt		3.06	□□□□□ -1.92
SIP1	P32578	YER079W	YER079W	633 nt		3.06	□□□□□ -1.92
SIP1	P32578	RPS26B	YER131W	360 nt		3.06	□□□□□ -1.92
SIP1	P32578	YGR017W	YGR017W	894 nt		3.06	□□□□□ -1.92
SIP1	P32578	MNT3	YIL014W	1893 nt		3.06	□□□□□ -1.92
SIP1	P32578	MDV1	YJL112W	2145 nt		3.06	□□□□□ -1.92
SIP1	P32578	NFU1	YKL040C	771 nt		3.06	□□□□□ -1.92
SIP1	P32578	YKL068W-A	YKL068W-A	237 nt		3.06	□□□□□ -1.92
SIP1	P32578	SDH3	YKL141W	597 nt		3.06	□□□□□ -1.92
SIP1	P32578	SPE1	YKL184W	1401 nt		3.06	□□□□□ -1.92
SIP1	P32578	YKR078W	YKR078W	1758 nt		3.06	□□□□□ -1.92
SIP1	P32578	SLA1	YBL007C	3735 nt		3.06	□□□□□ -1.92
SIP1	P32578	RIM11	YMR139W	1113 nt		3.06	□□□□□ -1.92
SIP1	P32578	CEP3	YMR168C	1827 nt		3.06	□□□□□ -1.92
SIP1	P32578	RRD2	YPL152W	1077 nt		3.06	□□□□□ -1.92
SIP1	P32578	IRC16	YPR038W	360 nt		3.06	□□□□□ -1.92
SIP1	P32578	snR54	snR54	86 nt		3.06	□□□□□ -1.92
SIP1	P32578	GCN1	YGL195W	8019 nt		3.05	□□□□□ -1.92
SIP1	P32578	MYO5	YMR109W	3660 nt		3.05	□□□□□ -1.92
SIP1	P32578	JJJ2	YJL162C	1752 nt		3.05	□□□□□ -1.92
SIP1	P32578	TCP1	YDR212W	1680 nt		3.05	□□□□□ -1.92
SIP1	P32578	XRN1	YGL173C	4587 nt		3.05	□□□□□ -1.92
SIP1	P32578	AHA1	YDR214W	1053 nt		3.05	□□□□□ -1.92
SIP1	P32578	NSA2	YER126C	786 nt		3.05	□□□□□ -1.92

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 19.4 ms