Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPREP23469 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPREP23469 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPREP23469 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPREP23469 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPREP23469 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPREP23469 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPREP23469 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPREP23469 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPREP23469 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPREP23469 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPREP23469 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPREP23469 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPREP23469 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPREP23469 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPREP23469 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPREP23469 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPREP23469 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPREP23469 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPREP23469 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPREP23469 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPREP23469 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPREP23469 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPREP23469 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPREP23469 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPREP23469 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPREP23469 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPREP23469 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPREP23469 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPREP23469 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPREP23469 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPREP23469 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPREP23469 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPREP23469 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPREP23469 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPREP23469 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPREP23469 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPREP23469 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPREP23469 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPREP23469 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPREP23469 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPREP23469 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPREP23469 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPREP23469 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPREP23469 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPREP23469 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPREP23469 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPREP23469 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPREP23469 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPREP23469 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPREP23469 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPREP23469 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPREP23469 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPREP23469 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPREP23469 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPREP23469 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPREP23469 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPREP23469 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPREP23469 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPREP23469 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPREP23469 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPREP23469 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPREP23469 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPREP23469 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPREP23469 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPREP23469 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPREP23469 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPREP23469 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPREP23469 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPREP23469 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPREP23469 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPREP23469 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPREP23469 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPREP23469 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPREP23469 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPREP23469 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPREP23469 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPREP23469 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPREP23469 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPREP23469 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPREP23469 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PTPREP23469 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PTPREP23469 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPREP23469 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPREP23469 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPREP23469 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPREP23469 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPREP23469 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPREP23469 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPREP23469 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPREP23469 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPREP23469 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPREP23469 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPREP23469 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPREP23469 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPREP23469 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPREP23469 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPREP23469 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPREP23469 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPREP23469 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms