Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FGFR3P22607 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FGFR3P22607 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FGFR3P22607 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FGFR3P22607 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FGFR3P22607 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FGFR3P22607 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FGFR3P22607 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FGFR3P22607 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FGFR3P22607 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FGFR3P22607 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FGFR3P22607 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FGFR3P22607 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FGFR3P22607 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FGFR3P22607 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FGFR3P22607 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FGFR3P22607 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FGFR3P22607 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FGFR3P22607 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FGFR3P22607 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FGFR3P22607 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FGFR3P22607 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FGFR3P22607 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FGFR3P22607 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FGFR3P22607 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FGFR3P22607 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FGFR3P22607 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FGFR3P22607 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FGFR3P22607 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FGFR3P22607 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FGFR3P22607 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FGFR3P22607 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FGFR3P22607 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FGFR3P22607 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FGFR3P22607 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FGFR3P22607 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FGFR3P22607 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FGFR3P22607 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FGFR3P22607 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FGFR3P22607 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FGFR3P22607 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FGFR3P22607 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FGFR3P22607 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FGFR3P22607 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FGFR3P22607 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FGFR3P22607 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FGFR3P22607 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
FGFR3P22607 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FGFR3P22607 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FGFR3P22607 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FGFR3P22607 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FGFR3P22607 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FGFR3P22607 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FGFR3P22607 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FGFR3P22607 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FGFR3P22607 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FGFR3P22607 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FGFR3P22607 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FGFR3P22607 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FGFR3P22607 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FGFR3P22607 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FGFR3P22607 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FGFR3P22607 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FGFR3P22607 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FGFR3P22607 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FGFR3P22607 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FGFR3P22607 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FGFR3P22607 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGFR3P22607 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGFR3P22607 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGFR3P22607 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGFR3P22607 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGFR3P22607 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGFR3P22607 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGFR3P22607 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGFR3P22607 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FGFR3P22607 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FGFR3P22607 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGFR3P22607 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGFR3P22607 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGFR3P22607 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FGFR3P22607 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGFR3P22607 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGFR3P22607 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGFR3P22607 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGFR3P22607 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGFR3P22607 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGFR3P22607 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGFR3P22607 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGFR3P22607 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGFR3P22607 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FGFR3P22607 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FGFR3P22607 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FGFR3P22607 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FGFR3P22607 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FGFR3P22607 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FGFR3P22607 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
FGFR3P22607 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FGFR3P22607 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FGFR3P22607 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms