Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM21P19474 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM21P19474 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM21P19474 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM21P19474 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM21P19474 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM21P19474 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM21P19474 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM21P19474 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM21P19474 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM21P19474 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM21P19474 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM21P19474 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM21P19474 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM21P19474 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM21P19474 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM21P19474 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM21P19474 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM21P19474 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM21P19474 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM21P19474 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM21P19474 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM21P19474 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM21P19474 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM21P19474 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM21P19474 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM21P19474 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM21P19474 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM21P19474 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM21P19474 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM21P19474 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM21P19474 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM21P19474 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM21P19474 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM21P19474 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM21P19474 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM21P19474 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM21P19474 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM21P19474 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM21P19474 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM21P19474 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM21P19474 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM21P19474 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM21P19474 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM21P19474 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM21P19474 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM21P19474 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM21P19474 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM21P19474 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM21P19474 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM21P19474 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM21P19474 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM21P19474 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM21P19474 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM21P19474 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM21P19474 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM21P19474 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM21P19474 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM21P19474 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM21P19474 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM21P19474 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM21P19474 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM21P19474 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM21P19474 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM21P19474 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM21P19474 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM21P19474 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM21P19474 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM21P19474 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TRIM21P19474 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TRIM21P19474 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TRIM21P19474 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM21P19474 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM21P19474 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM21P19474 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM21P19474 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM21P19474 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM21P19474 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM21P19474 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM21P19474 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM21P19474 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM21P19474 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM21P19474 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM21P19474 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM21P19474 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM21P19474 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM21P19474 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM21P19474 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM21P19474 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM21P19474 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM21P19474 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM21P19474 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM21P19474 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM21P19474 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM21P19474 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM21P19474 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM21P19474 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM21P19474 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM21P19474 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM21P19474 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms