Protein–RNA interactions for Protein: P18085

ARF4, ADP-ribosylation factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF4P18085 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARF4P18085 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ARF4P18085 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARF4P18085 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARF4P18085 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARF4P18085 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ARF4P18085 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARF4P18085 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ARF4P18085 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARF4P18085 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARF4P18085 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARF4P18085 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARF4P18085 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARF4P18085 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARF4P18085 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARF4P18085 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARF4P18085 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARF4P18085 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARF4P18085 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARF4P18085 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARF4P18085 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ARF4P18085 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ARF4P18085 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ARF4P18085 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ARF4P18085 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARF4P18085 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARF4P18085 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARF4P18085 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARF4P18085 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARF4P18085 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARF4P18085 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARF4P18085 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARF4P18085 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ARF4P18085 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARF4P18085 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ARF4P18085 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARF4P18085 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ARF4P18085 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ARF4P18085 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARF4P18085 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARF4P18085 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARF4P18085 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARF4P18085 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARF4P18085 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARF4P18085 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARF4P18085 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARF4P18085 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARF4P18085 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARF4P18085 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARF4P18085 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARF4P18085 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARF4P18085 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARF4P18085 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARF4P18085 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ARF4P18085 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ARF4P18085 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARF4P18085 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARF4P18085 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARF4P18085 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARF4P18085 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARF4P18085 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARF4P18085 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARF4P18085 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARF4P18085 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARF4P18085 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARF4P18085 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARF4P18085 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARF4P18085 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARF4P18085 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARF4P18085 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARF4P18085 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARF4P18085 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARF4P18085 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARF4P18085 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARF4P18085 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARF4P18085 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARF4P18085 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARF4P18085 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARF4P18085 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARF4P18085 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARF4P18085 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARF4P18085 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARF4P18085 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ARF4P18085 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARF4P18085 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARF4P18085 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ARF4P18085 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARF4P18085 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARF4P18085 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARF4P18085 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARF4P18085 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARF4P18085 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARF4P18085 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARF4P18085 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARF4P18085 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARF4P18085 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARF4P18085 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARF4P18085 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARF4P18085 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARF4P18085 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms