Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BMP3P12645 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BMP3P12645 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BMP3P12645 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BMP3P12645 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BMP3P12645 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BMP3P12645 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BMP3P12645 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BMP3P12645 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BMP3P12645 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BMP3P12645 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BMP3P12645 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
BMP3P12645 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BMP3P12645 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BMP3P12645 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BMP3P12645 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BMP3P12645 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BMP3P12645 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BMP3P12645 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BMP3P12645 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
BMP3P12645 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BMP3P12645 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BMP3P12645 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BMP3P12645 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BMP3P12645 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
BMP3P12645 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
BMP3P12645 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24■■□□□ 1.43
BMP3P12645 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
BMP3P12645 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
BMP3P12645 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BMP3P12645 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24■■□□□ 1.43
BMP3P12645 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
BMP3P12645 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BMP3P12645 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BMP3P12645 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BMP3P12645 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BMP3P12645 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
BMP3P12645 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BMP3P12645 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BMP3P12645 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BMP3P12645 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BMP3P12645 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BMP3P12645 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BMP3P12645 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BMP3P12645 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
BMP3P12645 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BMP3P12645 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BMP3P12645 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BMP3P12645 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BMP3P12645 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BMP3P12645 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BMP3P12645 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BMP3P12645 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BMP3P12645 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BMP3P12645 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BMP3P12645 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BMP3P12645 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BMP3P12645 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BMP3P12645 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BMP3P12645 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BMP3P12645 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
BMP3P12645 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BMP3P12645 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BMP3P12645 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BMP3P12645 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BMP3P12645 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BMP3P12645 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BMP3P12645 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BMP3P12645 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BMP3P12645 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BMP3P12645 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BMP3P12645 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BMP3P12645 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BMP3P12645 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BMP3P12645 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BMP3P12645 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BMP3P12645 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BMP3P12645 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BMP3P12645 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BMP3P12645 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BMP3P12645 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BMP3P12645 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
BMP3P12645 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BMP3P12645 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BMP3P12645 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BMP3P12645 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BMP3P12645 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BMP3P12645 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BMP3P12645 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BMP3P12645 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BMP3P12645 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BMP3P12645 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BMP3P12645 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BMP3P12645 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BMP3P12645 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BMP3P12645 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BMP3P12645 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BMP3P12645 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BMP3P12645 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BMP3P12645 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms