Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
LAMC1P11047 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
LAMC1P11047 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
LAMC1P11047 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
LAMC1P11047 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
LAMC1P11047 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
LAMC1P11047 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
LAMC1P11047 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
LAMC1P11047 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
LAMC1P11047 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
LAMC1P11047 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
LAMC1P11047 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
LAMC1P11047 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
LAMC1P11047 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
LAMC1P11047 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
LAMC1P11047 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
LAMC1P11047 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
LAMC1P11047 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
LAMC1P11047 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
LAMC1P11047 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
LAMC1P11047 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
LAMC1P11047 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
LAMC1P11047 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
LAMC1P11047 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
LAMC1P11047 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
LAMC1P11047 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC29.56■■■□□ 2.32
LAMC1P11047 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
LAMC1P11047 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
LAMC1P11047 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
LAMC1P11047 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
LAMC1P11047 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
LAMC1P11047 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
LAMC1P11047 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
LAMC1P11047 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
LAMC1P11047 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
LAMC1P11047 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
LAMC1P11047 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
LAMC1P11047 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
LAMC1P11047 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
LAMC1P11047 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
LAMC1P11047 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
LAMC1P11047 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
LAMC1P11047 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
LAMC1P11047 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
LAMC1P11047 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
LAMC1P11047 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
LAMC1P11047 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
LAMC1P11047 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
LAMC1P11047 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
LAMC1P11047 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
LAMC1P11047 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
LAMC1P11047 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
LAMC1P11047 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
LAMC1P11047 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
LAMC1P11047 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
LAMC1P11047 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
LAMC1P11047 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
LAMC1P11047 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
LAMC1P11047 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
LAMC1P11047 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
LAMC1P11047 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
LAMC1P11047 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
LAMC1P11047 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
LAMC1P11047 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
LAMC1P11047 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
LAMC1P11047 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
LAMC1P11047 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
LAMC1P11047 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
LAMC1P11047 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
LAMC1P11047 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
LAMC1P11047 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
LAMC1P11047 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
LAMC1P11047 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
LAMC1P11047 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
LAMC1P11047 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
LAMC1P11047 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
LAMC1P11047 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
LAMC1P11047 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
LAMC1P11047 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
LAMC1P11047 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
LAMC1P11047 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
LAMC1P11047 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
LAMC1P11047 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
LAMC1P11047 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
LAMC1P11047 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
LAMC1P11047 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
LAMC1P11047 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
LAMC1P11047 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
LAMC1P11047 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
LAMC1P11047 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
LAMC1P11047 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
LAMC1P11047 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
LAMC1P11047 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
LAMC1P11047 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
LAMC1P11047 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
LAMC1P11047 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
LAMC1P11047 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
LAMC1P11047 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC29.49■■■□□ 2.31
LAMC1P11047 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
LAMC1P11047 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms