Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD0

RGPD1, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD1P0DJD0 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RGPD1P0DJD0 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RGPD1P0DJD0 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RGPD1P0DJD0 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RGPD1P0DJD0 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RGPD1P0DJD0 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RGPD1P0DJD0 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RGPD1P0DJD0 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RGPD1P0DJD0 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RGPD1P0DJD0 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RGPD1P0DJD0 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RGPD1P0DJD0 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RGPD1P0DJD0 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RGPD1P0DJD0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RGPD1P0DJD0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RGPD1P0DJD0 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
RGPD1P0DJD0 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RGPD1P0DJD0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RGPD1P0DJD0 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RGPD1P0DJD0 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RGPD1P0DJD0 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RGPD1P0DJD0 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RGPD1P0DJD0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RGPD1P0DJD0 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RGPD1P0DJD0 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RGPD1P0DJD0 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RGPD1P0DJD0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RGPD1P0DJD0 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RGPD1P0DJD0 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RGPD1P0DJD0 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RGPD1P0DJD0 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RGPD1P0DJD0 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RGPD1P0DJD0 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RGPD1P0DJD0 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RGPD1P0DJD0 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RGPD1P0DJD0 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RGPD1P0DJD0 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RGPD1P0DJD0 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RGPD1P0DJD0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RGPD1P0DJD0 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RGPD1P0DJD0 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RGPD1P0DJD0 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
RGPD1P0DJD0 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RGPD1P0DJD0 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RGPD1P0DJD0 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RGPD1P0DJD0 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RGPD1P0DJD0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RGPD1P0DJD0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
RGPD1P0DJD0 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RGPD1P0DJD0 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RGPD1P0DJD0 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RGPD1P0DJD0 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RGPD1P0DJD0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
RGPD1P0DJD0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RGPD1P0DJD0 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RGPD1P0DJD0 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RGPD1P0DJD0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RGPD1P0DJD0 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RGPD1P0DJD0 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RGPD1P0DJD0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RGPD1P0DJD0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RGPD1P0DJD0 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RGPD1P0DJD0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RGPD1P0DJD0 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RGPD1P0DJD0 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
RGPD1P0DJD0 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RGPD1P0DJD0 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RGPD1P0DJD0 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RGPD1P0DJD0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RGPD1P0DJD0 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RGPD1P0DJD0 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RGPD1P0DJD0 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RGPD1P0DJD0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RGPD1P0DJD0 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RGPD1P0DJD0 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RGPD1P0DJD0 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RGPD1P0DJD0 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RGPD1P0DJD0 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
RGPD1P0DJD0 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RGPD1P0DJD0 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RGPD1P0DJD0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RGPD1P0DJD0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RGPD1P0DJD0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RGPD1P0DJD0 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RGPD1P0DJD0 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RGPD1P0DJD0 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RGPD1P0DJD0 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
RGPD1P0DJD0 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RGPD1P0DJD0 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
RGPD1P0DJD0 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RGPD1P0DJD0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RGPD1P0DJD0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RGPD1P0DJD0 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RGPD1P0DJD0 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RGPD1P0DJD0 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RGPD1P0DJD0 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RGPD1P0DJD0 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RGPD1P0DJD0 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RGPD1P0DJD0 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
RGPD1P0DJD0 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms