Protein–RNA interactions for Protein: P0CX28

RPL42B, 60S ribosomal protein L42-B, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 106 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPL42BP0CX28 ECM16YMR128W 3804 nt2.85□□□□□ -1.95
RPL42BP0CX28 YOL085W-AYOL085W-A 213 nt2.85□□□□□ -1.95
RPL42BP0CX28 CBP2YHL038C 1893 nt2.85□□□□□ -1.95
RPL42BP0CX28 LCB5YLR260W 2064 nt2.84□□□□□ -1.95
RPL42BP0CX28 ATG21YPL100W 1491 nt2.84□□□□□ -1.95
RPL42BP0CX28 MRPL11YDL202W 750 nt2.84□□□□□ -1.95
RPL42BP0CX28 YDR149CYDR149C 708 nt2.84□□□□□ -1.95
RPL42BP0CX28 AIM11YER093C-A 414 nt2.84□□□□□ -1.95
RPL42BP0CX28 YGR051CYGR051C 324 nt2.84□□□□□ -1.95
RPL42BP0CX28 RRT16YNL105W 429 nt2.84□□□□□ -1.95
RPL42BP0CX28 YOL134CYOL134C 390 nt2.84□□□□□ -1.95
RPL42BP0CX28 YBR032WYBR032W 303 nt2.84□□□□□ -1.95
RPL42BP0CX28 MCD4YKL165C 2760 nt2.84□□□□□ -1.95
RPL42BP0CX28 SSP1YHR184W 1716 nt2.84□□□□□ -1.96
RPL42BP0CX28 NOG1YPL093W 1944 nt2.83□□□□□ -1.96
RPL42BP0CX28 UBP5YER144C 2418 nt2.83□□□□□ -1.96
RPL42BP0CX28 PBS2YJL128C 2007 nt2.83□□□□□ -1.96
RPL42BP0CX28 YCK2YNL154C 1641 nt2.83□□□□□ -1.96
RPL42BP0CX28 ARG2YJL071W 1725 nt2.83□□□□□ -1.96
RPL42BP0CX28 BAR1YIL015W 1764 nt2.83□□□□□ -1.96
RPL42BP0CX28 SMB1YER029C 591 nt2.83□□□□□ -1.96
RPL42BP0CX28 YGL042CYGL042C 306 nt2.83□□□□□ -1.96
RPL42BP0CX28 RPS20YHL015W 366 nt2.83□□□□□ -1.96
RPL42BP0CX28 TCD1YHR003C 1290 nt2.83□□□□□ -1.96
RPL42BP0CX28 ANB1YJR047C 474 nt2.83□□□□□ -1.96
RPL42BP0CX28 YLR269CYLR269C 351 nt2.83□□□□□ -1.96
RPL42BP0CX28 HHF2YNL030W 312 nt2.83□□□□□ -1.96
RPL42BP0CX28 YDL176WYDL176W 2127 nt2.83□□□□□ -1.96
RPL42BP0CX28 YGR237CYGR237C 2358 nt2.82□□□□□ -1.96
RPL42BP0CX28 ATP25YMR098C 1839 nt2.82□□□□□ -1.96
RPL42BP0CX28 LCB4YOR171C 1875 nt2.82□□□□□ -1.96
RPL42BP0CX28 SEG1YMR086W 2883 nt2.82□□□□□ -1.96
RPL42BP0CX28 RTT105YER104W 627 nt2.82□□□□□ -1.96
RPL42BP0CX28 RPS26BYER131W 360 nt2.82□□□□□ -1.96
RPL42BP0CX28 RPL1BYGL135W 654 nt2.82□□□□□ -1.96
RPL42BP0CX28 BSC3YLR465C 309 nt2.82□□□□□ -1.96
RPL42BP0CX28 RPL1AYPL220W 654 nt2.82□□□□□ -1.96
RPL42BP0CX28 OSH3YHR073W 2991 nt2.82□□□□□ -1.96
RPL42BP0CX28 MUS81YDR386W 1899 nt2.82□□□□□ -1.96
RPL42BP0CX28 FLO10YKR102W 3510 nt2.81□□□□□ -1.96
RPL42BP0CX28 MDN1YLR106C 14733 nt2.81□□□□□ -1.96
RPL42BP0CX28 SRC1YML034W 2505 nt2.81□□□□□ -1.96
RPL42BP0CX28 21S_rRNA21S_rRNA 3296 nt2.81□□□□□ -1.96
RPL42BP0CX28 YCR090CYCR090C 549 nt2.81□□□□□ -1.96
RPL42BP0CX28 AHA1YDR214W 1053 nt2.81□□□□□ -1.96
RPL42BP0CX28 YDR464C-AYDR464C-A 189 nt2.81□□□□□ -1.96
RPL42BP0CX28 YER091C-AYER091C-A 222 nt2.81□□□□□ -1.96
RPL42BP0CX28 FMP10YER182W 735 nt2.81□□□□□ -1.96
RPL42BP0CX28 LIF1YGL090W 1266 nt2.81□□□□□ -1.96
RPL42BP0CX28 RPS0AYGR214W 759 nt2.81□□□□□ -1.96
RPL42BP0CX28 RTT102YGR275W 474 nt2.81□□□□□ -1.96
RPL42BP0CX28 YHR032C-AYHR032C-A 120 nt2.81□□□□□ -1.96
RPL42BP0CX28 GEP4YHR100C 558 nt2.81□□□□□ -1.96
RPL42BP0CX28 CRG1YHR209W 876 nt2.81□□□□□ -1.96
RPL42BP0CX28 YJL169WYJL169W 369 nt2.81□□□□□ -1.96
RPL42BP0CX28 OST6YML019W 999 nt2.81□□□□□ -1.96
RPL42BP0CX28 YOR199WYOR199W 330 nt2.81□□□□□ -1.96
RPL42BP0CX28 YPL185WYPL185W 396 nt2.81□□□□□ -1.96
RPL42BP0CX28 YPR053CYPR053C 456 nt2.81□□□□□ -1.96
RPL42BP0CX28 DIT2YDR402C 1470 nt2.81□□□□□ -1.96
RPL42BP0CX28 GPI17YDR434W 1605 nt2.81□□□□□ -1.96
RPL42BP0CX28 ERB1YMR049C 2424 nt2.81□□□□□ -1.96
RPL42BP0CX28 UTP13YLR222C 2454 nt2.81□□□□□ -1.96
RPL42BP0CX28 TMA108YIL137C 2841 nt2.8□□□□□ -1.96
RPL42BP0CX28 YRM1YOR172W 2361 nt2.8□□□□□ -1.96
RPL42BP0CX28 GSC2YGR032W 5688 nt2.8□□□□□ -1.96
RPL42BP0CX28 JJJ2YJL162C 1752 nt2.8□□□□□ -1.96
RPL42BP0CX28 SPT4YGR063C 309 nt2.8□□□□□ -1.96
RPL42BP0CX28 YIL115W-AYIL115W-A 372 nt2.8□□□□□ -1.96
RPL42BP0CX28 YKL162C-AYKL162C-A 153 nt2.8□□□□□ -1.96
RPL42BP0CX28 RPL40BYKR094C 387 nt2.8□□□□□ -1.96
RPL42BP0CX28 YML099W-AYML099W-A 330 nt2.8□□□□□ -1.96
RPL42BP0CX28 RAD14YMR201C 1116 nt2.8□□□□□ -1.96
RPL42BP0CX28 YNL179CYNL179C 438 nt2.8□□□□□ -1.96
RPL42BP0CX28 HFM1YGL251C 3564 nt2.8□□□□□ -1.96
RPL42BP0CX28 CCM1YGR150C 2595 nt2.8□□□□□ -1.96
RPL42BP0CX28 KIN4YOR233W 2403 nt2.8□□□□□ -1.96
RPL42BP0CX28 YJR030CYJR030C 2238 nt2.8□□□□□ -1.96
RPL42BP0CX28 EMP70YLR083C 2004 nt2.8□□□□□ -1.96
RPL42BP0CX28 SPT16YGL207W 3108 nt2.79□□□□□ -1.96
RPL42BP0CX28 YNR063WYNR063W 1824 nt2.79□□□□□ -1.96
RPL42BP0CX28 TOP1YOL006C 2310 nt2.79□□□□□ -1.96
RPL42BP0CX28 CIN1YOR349W 3045 nt2.79□□□□□ -1.96
RPL42BP0CX28 YCR081C-AYCR081C-A 237 nt2.79□□□□□ -1.96
RPL42BP0CX28 YDL228CYDL228C 642 nt2.79□□□□□ -1.96
RPL42BP0CX28 YEL032C-AYEL032C-A 162 nt2.79□□□□□ -1.96
RPL42BP0CX28 YPS5YGL259W 498 nt2.79□□□□□ -1.96
RPL42BP0CX28 MYO3YKL129C 3819 nt2.79□□□□□ -1.96
RPL42BP0CX28 YNR042WYNR042W 429 nt2.79□□□□□ -1.96
RPL42BP0CX28 HSP10YOR020C 321 nt2.79□□□□□ -1.96
RPL42BP0CX28 YPL197CYPL197C 414 nt2.79□□□□□ -1.96
RPL42BP0CX28 HEF3YNL014W 3135 nt2.79□□□□□ -1.96
RPL42BP0CX28 URB2YJR041C 3525 nt2.78□□□□□ -1.96
RPL42BP0CX28 YLR352WYLR352W 2424 nt2.78□□□□□ -1.96
RPL42BP0CX28 AIM7YDR063W 450 nt2.78□□□□□ -1.96
RPL42BP0CX28 YER038W-AYER038W-A 381 nt2.78□□□□□ -1.96
RPL42BP0CX28 SOD1YJR104C 465 nt2.78□□□□□ -1.96
RPL42BP0CX28 YLR302CYLR302C 363 nt2.78□□□□□ -1.96
RPL42BP0CX28 YOL159C-AYOL159C-A 273 nt2.78□□□□□ -1.96
RPL42BP0CX28 MES1YGR264C 2256 nt2.78□□□□□ -1.96
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