Protein–RNA interactions for Protein: P0CF97

FAM200B, Protein FAM200B, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM200BP0CF97 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM200BP0CF97 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM200BP0CF97 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM200BP0CF97 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
FAM200BP0CF97 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
FAM200BP0CF97 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM200BP0CF97 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM200BP0CF97 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM200BP0CF97 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM200BP0CF97 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM200BP0CF97 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM200BP0CF97 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM200BP0CF97 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM200BP0CF97 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM200BP0CF97 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM200BP0CF97 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM200BP0CF97 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM200BP0CF97 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM200BP0CF97 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM200BP0CF97 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM200BP0CF97 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM200BP0CF97 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM200BP0CF97 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM200BP0CF97 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM200BP0CF97 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM200BP0CF97 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM200BP0CF97 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM200BP0CF97 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM200BP0CF97 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM200BP0CF97 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM200BP0CF97 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM200BP0CF97 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM200BP0CF97 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM200BP0CF97 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM200BP0CF97 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM200BP0CF97 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM200BP0CF97 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM200BP0CF97 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM200BP0CF97 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM200BP0CF97 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM200BP0CF97 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM200BP0CF97 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM200BP0CF97 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM200BP0CF97 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM200BP0CF97 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM200BP0CF97 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM200BP0CF97 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM200BP0CF97 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM200BP0CF97 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM200BP0CF97 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM200BP0CF97 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM200BP0CF97 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM200BP0CF97 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM200BP0CF97 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM200BP0CF97 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM200BP0CF97 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM200BP0CF97 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM200BP0CF97 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM200BP0CF97 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM200BP0CF97 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM200BP0CF97 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM200BP0CF97 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM200BP0CF97 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM200BP0CF97 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM200BP0CF97 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM200BP0CF97 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM200BP0CF97 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM200BP0CF97 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM200BP0CF97 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM200BP0CF97 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM200BP0CF97 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM200BP0CF97 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM200BP0CF97 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM200BP0CF97 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM200BP0CF97 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM200BP0CF97 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM200BP0CF97 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM200BP0CF97 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM200BP0CF97 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM200BP0CF97 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM200BP0CF97 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM200BP0CF97 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM200BP0CF97 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM200BP0CF97 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM200BP0CF97 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM200BP0CF97 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM200BP0CF97 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM200BP0CF97 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM200BP0CF97 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM200BP0CF97 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM200BP0CF97 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM200BP0CF97 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM200BP0CF97 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM200BP0CF97 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM200BP0CF97 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM200BP0CF97 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM200BP0CF97 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM200BP0CF97 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM200BP0CF97 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM200BP0CF97 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
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