Protein–RNA interactions for Protein: P08151

GLI1, Zinc finger protein GLI1, humanhuman

Predictions only

Length 1,106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI1P08151 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GLI1P08151 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GLI1P08151 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GLI1P08151 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GLI1P08151 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GLI1P08151 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GLI1P08151 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GLI1P08151 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GLI1P08151 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GLI1P08151 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GLI1P08151 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GLI1P08151 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GLI1P08151 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GLI1P08151 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GLI1P08151 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GLI1P08151 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GLI1P08151 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GLI1P08151 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GLI1P08151 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GLI1P08151 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GLI1P08151 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GLI1P08151 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GLI1P08151 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GLI1P08151 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GLI1P08151 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GLI1P08151 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GLI1P08151 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GLI1P08151 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GLI1P08151 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GLI1P08151 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GLI1P08151 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GLI1P08151 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GLI1P08151 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GLI1P08151 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GLI1P08151 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GLI1P08151 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GLI1P08151 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GLI1P08151 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GLI1P08151 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GLI1P08151 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GLI1P08151 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GLI1P08151 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GLI1P08151 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GLI1P08151 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GLI1P08151 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GLI1P08151 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GLI1P08151 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GLI1P08151 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GLI1P08151 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GLI1P08151 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GLI1P08151 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GLI1P08151 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GLI1P08151 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GLI1P08151 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GLI1P08151 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GLI1P08151 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GLI1P08151 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GLI1P08151 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GLI1P08151 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GLI1P08151 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GLI1P08151 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GLI1P08151 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GLI1P08151 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GLI1P08151 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GLI1P08151 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GLI1P08151 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GLI1P08151 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GLI1P08151 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GLI1P08151 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GLI1P08151 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GLI1P08151 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GLI1P08151 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GLI1P08151 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GLI1P08151 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GLI1P08151 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GLI1P08151 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GLI1P08151 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GLI1P08151 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GLI1P08151 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GLI1P08151 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GLI1P08151 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GLI1P08151 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GLI1P08151 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GLI1P08151 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GLI1P08151 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GLI1P08151 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GLI1P08151 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GLI1P08151 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GLI1P08151 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GLI1P08151 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GLI1P08151 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GLI1P08151 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GLI1P08151 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GLI1P08151 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GLI1P08151 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GLI1P08151 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GLI1P08151 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GLI1P08151 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GLI1P08151 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GLI1P08151 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms