Protein–RNA interactions for Protein: O95613

PCNT, Pericentrin, humanhuman

Predictions only

Length 3,336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNTO95613 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
PCNTO95613 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PCNTO95613 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
PCNTO95613 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCNTO95613 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCNTO95613 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCNTO95613 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCNTO95613 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCNTO95613 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCNTO95613 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCNTO95613 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCNTO95613 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCNTO95613 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCNTO95613 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCNTO95613 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCNTO95613 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCNTO95613 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCNTO95613 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCNTO95613 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCNTO95613 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCNTO95613 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCNTO95613 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCNTO95613 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PCNTO95613 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCNTO95613 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCNTO95613 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCNTO95613 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PCNTO95613 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCNTO95613 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCNTO95613 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PCNTO95613 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCNTO95613 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCNTO95613 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCNTO95613 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCNTO95613 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCNTO95613 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCNTO95613 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCNTO95613 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCNTO95613 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCNTO95613 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCNTO95613 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCNTO95613 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCNTO95613 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCNTO95613 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCNTO95613 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PCNTO95613 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PCNTO95613 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCNTO95613 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCNTO95613 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCNTO95613 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCNTO95613 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCNTO95613 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCNTO95613 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCNTO95613 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCNTO95613 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCNTO95613 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCNTO95613 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCNTO95613 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCNTO95613 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCNTO95613 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCNTO95613 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCNTO95613 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PCNTO95613 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCNTO95613 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCNTO95613 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCNTO95613 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCNTO95613 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PCNTO95613 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCNTO95613 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCNTO95613 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCNTO95613 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCNTO95613 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCNTO95613 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCNTO95613 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCNTO95613 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCNTO95613 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCNTO95613 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCNTO95613 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PCNTO95613 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCNTO95613 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PCNTO95613 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PCNTO95613 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PCNTO95613 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCNTO95613 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCNTO95613 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCNTO95613 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCNTO95613 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCNTO95613 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCNTO95613 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCNTO95613 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCNTO95613 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCNTO95613 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PCNTO95613 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCNTO95613 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCNTO95613 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCNTO95613 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCNTO95613 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCNTO95613 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PCNTO95613 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCNTO95613 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms